Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A29 F36 I0 R1
|
179 |
9550.8 |
8038540 |
98.3% |
7901884 |
136.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP022686 |
1,632,501 |
T→G |
9.4% |
V166G (GTT→GGT) |
arcC → |
carbamate kinase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP022686 | 1,632,501 | 0 | T | G | 9.4%
| 305.1
/ 2.8
| 184 | V166G (GTT→GGT) | arcC | carbamate kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (55/104); new base G (19/4); total (75/109) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.68e-05 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 187 total aligned reads displayed.
CCGGCATTCCTCAACCCGACCAAGCCGATCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGTTATCGATAAAGACTGG > NZ_CP022686/1632362‑1632640
|
acAACCCGACCAAGCCGATCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCAtt < 7:101799/139‑1 (MQ=255)
aCCCGACCAAGCCGATCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTTGGTGGCCAAAACCGGGTTCTATCATTGaa > 5:764674/1‑140 (MQ=255)
gACCAAGCCGATCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTGGGCAAAACCGGTTGTTATCATTGaaaaat > 6:962170/1‑139 (MQ=255)
aCCAAGCCGATCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACCCTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGGCGTTGCGTGGCCACAAGCGGTGTGTATCATTGTAATAgg > 7:223598/1‑139 (MQ=255)
ccAAGCCGATCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGGTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGaa < 2:961381/140‑1 (MQ=255)
ccAAGCCGATCGGTTCGATCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCTTTGAAAAAGaa < 1:404276/140‑1 (MQ=255)
ccGATCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTAATGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCTGCAATCGTCGAGTACTTGCGTAGCCAAAACCGGATGAAATCATTGAAAAAGAAAccgg > 4:733030/1‑137 (MQ=255)
gATCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTa < 2:870299/140‑1 (MQ=255)
gATCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGGCGCGGCTATCGTCGTGTCGGTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTa < 6:202084/140‑1 (MQ=255)
gATCGGTTCGTTCTTTA‑CGAGCAAGAAGCTGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAATATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTaa < 8:926947/140‑1 (MQ=255)
aTCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCTAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTaa < 6:820504/140‑1 (MQ=255)
aTCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTaa < 7:951930/140‑1 (MQ=255)
aTCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGAAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTaa < 2:140047/140‑1 (MQ=255)
cGGTTCGTTCTATACCGAGCAAGAAGAAGAGCTACTGAAAAACCAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGGTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAg < 8:563503/140‑1 (MQ=255)
gttcgttcTTTCACGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGct < 5:686082/140‑1 (MQ=255)
gttcggtcTTTACCGAGCAAGAATCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGct < 3:817379/140‑1 (MQ=255)
gttagtgcTATACCGCGCAAGAAGCCGAGCTTCTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAACGAAGATGCGGGGCGCGGCTAGCGTCGTGGCGTTGCTTCGCCAAAACCGGGTGATATCATTGAAACAGAAACGGTTAAAGct < 6:188159/140‑1 (MQ=255)
ttcTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGt < 3:465658/140‑1 (MQ=255)
tACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTTCTTAGCCAAAACCGGGTGTTATAATTTAAAAAAAAACGGTTAAAACGCTGGTAGAtt > 7:32883/1‑139 (MQ=255)
aCCGAGCAAGAAGCAGCGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCGTCGCCAAAACCGGGTGCTTTAATTGAAAAAGACACGGTTAAATCTCTGGTAGATgg > 2:751240/1‑139 (MQ=255)
aCCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTAGCCAAAACCCGTTGCTATCATTGAAAAATAAACTGTTAAAGCACTGGTattagc > 1:730137/1‑135 (MQ=255)
aCCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACGCTGAAAGAAGATGCGGGGCGCGGCTATCGGCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGc < 6:610134/140‑1 (MQ=255)
aGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTTCTTCGCCAAAACCGGGTGTTATCATTGAAAAAGAAAAGGGTAAAGCTCTGGTAGCTGGCggg > 1:53867/1‑139 (MQ=255)
aGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTAGGCAAAACCCGTTGAAATCATTTAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTTGTAGATGCCggg > 6:111910/1‑139 (MQ=255)
aGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCATAGCCAAAACCGGTTGTTATCATTGAAAAATAAACGGTTTAAACTCAGGTAGATGGCggc > 7:441639/1‑139 (MQ=255)
gCAAGAAGCATAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAAGCTGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGAc < 4:229916/140‑1 (MQ=255)
gCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGAc < 1:307544/140‑1 (MQ=255)
gCAAGAACCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGGCGTTGCTTCGCCAAAACCTGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGAc < 5:405060/140‑1 (MQ=255)
agaagCATCTCTACTGACAATACAGTGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGGCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAgg < 5:241397/140‑1 (MQ=255)
aagCAGAGCTACTGACAAAACTGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAggtg < 6:592860/140‑1 (MQ=255)
caccTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTTAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGAt < 1:506613/137‑1 (MQ=255)
agCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATAATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATTCCGGACAGGTGGTGAta > 2:18796/1‑139 (MQ=255)
agCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCGTCGCCAAAACCGGTTGCTATGATTGAAAAATAAACCGTTAAAGCGCTGGTAGCTGCCGGGCAggtggggttc > 3:143696/1‑135 (MQ=255)
agCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGGCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATc < 2:722982/140‑1 (MQ=255)
aCTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCCAAAACGGTTTATATAATTGAAAAATAAACGGGTAAAGCTCTGTTAGATGCCGGCAAGGTGGTGATAAccc > 8:514632/1‑139 (MQ=255)
aCTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCg < 2:685780/140‑1 (MQ=255)
cTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGt < 3:178350/140‑1 (MQ=255)
cTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGt > 6:632180/1‑140 (MQ=255)
tGACAAAACAGTGTAACACTATGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGGCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGtt < 7:825878/140‑1 (MQ=255)
tGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGtt < 6:250137/140‑1 (MQ=255)
gACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGTTATGATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTATGGGAGATGCCGGACAGGTGGGGATCACCGTTg > 1:576546/1‑140 (MQ=255)
aaaaCAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATTATGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTTCTTCGCCAAAACCGGTTGATATAATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTTATAACCGTTGGCg > 6:306106/1‑140 (MQ=255)
aaaCATGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATTGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCgg < 3:956361/140‑1 (MQ=255)
aaCAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATAATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTATGGGAGATGCCGGACAGGGGGTGATCACCGTTGGCggg > 6:880157/1‑139 (MQ=255)
aaCAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGGTGATATCATTGAAAAAGAAACGGGTAAAGGTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATAACCGTTGGCggg > 8:253756/1‑139 (MQ=255)
aaCAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTGAGCCAAAACCGGTGGATATAATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCACTGGTTGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGGTGGCggg > 2:398119/1‑139 (MQ=255)
aaCAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCGTCGCCAAAACCCGTTGATATCATTTAAAAAGAAACGGTTAAATCTCTGGGAGATGCCGGACAGGTGGGGATCACCGGTGGCggg > 6:665089/1‑139 (MQ=255)
aGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGGCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAATGCTCGGGGAGATGGCGGACAGGTGGGGTTCACCGTTGGCgggggg > 8:413768/1‑139 (MQ=255)
gggTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTAGTTGCTTCGCCAAAACCCGGTGATATCATTGAAAAATAAACGGTTAAAGCTCTGGTATATTCCCGACAGGTGGTGATAACCGTTGGCggtggtg > 1:379182/1‑140 (MQ=255)
ggTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCggtggtgg < 2:522589/140‑1 (MQ=255)
ggTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCGTCGCCAAAACCCGTTGATATAATTGAAAAATAAACCGTTAAAGCACTGGTTGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGGTGGCggtggtgg > 3:555928/1‑140 (MQ=255)
ggTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGGGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCggtggtgg < 2:594214/140‑1 (MQ=255)
ggTTACACTATGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCGATCGTCGTGGCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCggtggtgg < 4:296120/140‑1 (MQ=255)
gTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCCGTTGATATAATTGAAAAAGAAACGGTTAAATCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCgggggtggt > 4:605975/1‑140 (MQ=255)
gTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGGTGCTTAGCCAACACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGGTTAAGCACTTGTTGAAGACGGCAAGGTGGTGATGACCGGTGGCggtggtggt > 5:117328/1‑140 (MQ=255)
tACACTCTGAAAGAAGATGCGGGGCGCGGCAATCGTCGTGGCGTTGGTTCGGGCAAACCGGGTGATATCATTGAAAAAAAAAAGGGTAAACATCAGGTAGATGCCGGACAGGTTGTGATAACCGTTGGAGGGGGTGGGAt > 6:258567/1‑140 (MQ=255)
cacTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGGCGTTGGTTCGCCAAAACCCGGTTATATGATTGAAAAATCAACGGTTAAAGCACGGGTTGATTCCGGCCAGGGGGGTATAACCCGTGGGGGGGGGGGTATcc > 3:402526/1‑140 (MQ=255)
ctctGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTAGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATAACCGTTGGCGGTGGTGGTATcccg > 2:7872/1‑139 (MQ=255)
tGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGGTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATAACCGTTGGCGGTGGTGGTTTACCGGtt > 3:948587/1‑140 (MQ=255)
tGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGGTTCGCCAAAACCGGGTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTTAAGCTCTGGTTGATGCCGGCCAGGTGGTGATAAACGGTGGCGGTGGTGGTTTCCCGGtt > 2:179290/1‑140 (MQ=255)
tGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGGTGTTATAATTGAAAAAGAAAAGGTTAAAGCGCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGGTGGCGGTGGTGGTATCCCTGtt > 4:185868/1‑140 (MQ=255)
tGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCGTAGCCAAAACCGGTTGATATAATTGAAAAAGAAAAGGTTAAAGCTCTGGTAGTTGCCGGGCAGGGGGTGATCACCGGTGGCGGGGGGGGTATgccgggt > 7:299432/1‑136 (MQ=255)
tGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGGCGTTGCTTCGCCCACACCGGGTTATATAATTGAAAAAGAAACTGTTTAAGATCTTGTTGATTCCGGGCAGGTGGTGCTACACGGTGGCGGTGGTGGTATCCCGGtt > 7:67189/1‑140 (MQ=255)
tGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGGCGTGTCGTTGGTTCGCCCCAACCCGTTGATATCATTGAAAAATAAACGGTTAAAGCTCGGGTAGATGCCGGCCAAGTGGGGATCACCGGTGGCGGGGGGGGTTTCCCTggt > 4:838284/1‑138 (MQ=255)
aaaGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTGGTTGCTTCGCCAAAACAGGTTGATATAATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTACATGCCGGCCAGGTGGGGATCACCGTTTGCGGGGGGGGGATACCGGTTAt > 8:635039/1‑140 (MQ=255)
aagaTGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGt < 8:707731/140‑1 (MQ=255)
gttGCGGGTCTCGGGTATCTGCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACTGGTTGATTTCTTTGTAAAAGATACGGTTTATGCTCTTGTATATGCCGGACAGGTGGTTATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGa < 6:395717/138‑1 (MQ=255)
gaTGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGa < 4:123942/140‑1 (MQ=255)
tGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGGTTCGCCAAAACCGGTTGATATAATTGAAAAAGAAACGGGTTAAGCTATGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCAACGTTTGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAg > 6:874484/1‑140 (MQ=255)
gCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAgg < 4:163734/140‑1 (MQ=255)
cGGTTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGt < 4:518880/140‑1 (MQ=255)
cGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGt < 7:688005/140‑1 (MQ=255)
cGGGTCGCGGCTATCGTCGTGGCTTTTCTTCGCGAAAACGGGTTGATATCATTGCAATAGTATCGGTTTTTGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCTCCGTTGGCGGTGGTTGTATCCCTGTTATTCGTGTAGGt < 7:383687/140‑1 (MQ=255)
cgcgGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCa > 2:574845/1‑140 (MQ=255)
cgcgGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGGTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGGAGATGCCGGACCGGGGGTGATCACCGGTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAAACa > 8:801671/1‑140 (MQ=255)
tctcgtcgTGGCGTTGCTTCTCCAAAACCTGTTGATATCATTGAAAAAGAACCGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCTGACAGGGGGTGATCACAGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCg < 3:236809/138‑1 (MQ=255)
tATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCg < 5:632180/140‑1 (MQ=255)
tATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCg < 7:352641/140‑1 (MQ=255)
tATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCg < 8:158438/140‑1 (MQ=255)
tATCGTCGTGTCGTTGCTTCGACAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCg < 5:882006/140‑1 (MQ=255)
tATCGTCGTGTCCTTGCTTCGCCAAAACCGGTTTATATCATTGAAAAAGAAAAGGTTAAATCTCTGGTAGATGCCGGACAGTTGGTGATCACCGTTGGCGTTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAAACATCTGCg < 8:322953/140‑1 (MQ=255)
tATCGGCGTGTCGTTGCGTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCg < 3:765968/140‑1 (MQ=255)
cgtgtcgtTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGc < 6:764674/140‑1 (MQ=255)
cgtTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAgcg < 3:589900/140‑1 (MQ=255)
cgtTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCGCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAgcg < 4:619411/140‑1 (MQ=255)
gtTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATAATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACATGTGGTGATCACCCTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCAACTGCGTGGTGCCAgcgc > 1:56606/1‑140 (MQ=255)
gCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGt > 6:355674/1‑140 (MQ=255)
cTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGtt < 6:691767/140‑1 (MQ=255)
ttCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGTTa < 2:316862/140‑1 (MQ=255)
ttCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGTTa < 6:910506/140‑1 (MQ=255)
ttCGCCAAAACCGGGTGATATCATTGCAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCTGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGAGGTTGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGTTa < 8:482905/140‑1 (MQ=255)
tCGCCATAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGTTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGTTAt < 2:156756/140‑1 (MQ=255)
cGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGTTATc > 2:736885/1‑140 (MQ=255)
aaaaCCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGTTATCGATa < 3:270026/140‑1 (MQ=255)
aaaaCCGGGTGATTACATTGAAAAACAAAAGGTTAAAGGTCTGGGAGATGCCGGACAGGTGGGGCTCACCGTTGGCGGTGGGGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGTTATCGATa < 7:732390/140‑1 (MQ=255)
aCCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGTTATCGATAAAg > 4:71159/1‑140 (MQ=255)
ccGGTTGATATCATTGAAAAAGAACCGGTTAAAGCTCTGGGAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGAGCCAGCGCGGTTATCGATAAAGa < 1:648525/140‑1 (MQ=255)
ccGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGTTATCGATAAAGa < 2:358472/140‑1 (MQ=255)
ggTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGTTATCGATAAAGACt < 1:825095/140‑1 (MQ=255)
ttGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGTTATCGATAAAGCCTgg > 1:776764/1‑140 (MQ=255)
|
CCGGCATTCCTCAACCCGACCAAGCCGATCGGTTCGTTCTTTACCGAGCAAGAAGCAGAGCTACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCGGGTCGCGGCTATCGTCGTGTCGTTGCTTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCCGGACAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGTTATCGATAAAGACTGG > NZ_CP022686/1632362‑1632640
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
