Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F36 I0 R1
|
179 |
8076.5 |
8499890 |
98.3% |
8355391 |
135.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP022686 |
4,764,877 |
T→G |
17.5% |
intergenic (‑57/‑204) |
ycfT ← / → lolC |
acyltransferase family protein/lipoprotein‑releasing ABC transporter permease subunit LolC |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP022686 | 4,764,877 | 0 | T | G | 17.5%
| 223.7
/ 9.9
| 149 | intergenic (‑57/‑204) | ycfT/lolC | acyltransferase family protein/lipoprotein‑releasing ABC transporter permease subunit LolC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (51/66); new base G (27/3); total (80/69) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.99e-06 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 165 total aligned reads displayed.
GTAATGACCGAGTGATAAATCACCACCAGACAAATACATAACCCTTTGATCTGGTTAATCCATAGCTCTTTTTGTTTCATCAGGACAACACGCTCTTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGTGGTGTAATGCGTATCTGTCTGTATTTGGTTATTTTTCAGATAAAGATCAGGCCACATGGCCGATGATAAAATGAGGCACTTTAGCCGATTGATTTGCCGGTACTTTTCAGATTAGCCCTGACGATCACTTACAGTTCA > NZ_CP022686/4764741‑4765015
|
gTAATGACCGAGTGATAAATCACCACCAGACAAATACATAACCCTTTGATCTGGTTAATCCATAGCTCTTTTTGTTTCATCAGGACAACACGCTCTTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCgtggt < 4:869798/140‑1 (MQ=255)
tAATGACCGAGTGATAAATCACCACCAGACAAATACATAACCCTTTGATCTGGTTAATCCATAGCTCTTTTTGTTTCATCAGGACAACACGCTCTTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCgtggtg < 5:138844/140‑1 (MQ=255)
aTGACCGAGTGATAAATCACCACCAGACAAATACATAACCCTTTGATCTGGTTAATCCATAGCTCTTTTTGTTTCATCAGGACAACACGCTCTTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCgcggtg < 7:680414/138‑1 (MQ=255)
aTGACCGAGTGATAAATCACCACCAGACAAATACATAACCCTTTGATCTGGTTAATCCATAGCTCTTTTTGTTTCATCAGGACAACACGCTCTTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGTGGTGTa < 2:134666/140‑1 (MQ=255)
aTGACCGAGTGATAAATCACCACCAGACAAATACATAACCCTTTGATCTGGTTAATCCATAGCTCTTTTTGTTTCATCAGGACAACACGCTCTTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGTGGTGTa > 1:900797/1‑140 (MQ=255)
aTGACCGAGTGATAAATCACCACCAGACAAATACATAACCCTTTGATCTGGTTAATCCATAGCTCTTTTTGTTTCATCAGGACAACACGCTCTTTTTATTTAAAATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCggggtgga > 1:480945/1‑138 (MQ=255)
aTGACCGAGTGATAAATCACCACCAGACAAATACATAACCCTTTGATCTGGATAATCCATAGCTCTTTTTGTTTCATCAGGACAACACGCTCTTTTTATGTACCATGCGTTTGATCCTGCGCGGCGAGTCGCggggtggt > 3:270613/1‑138 (MQ=255)
aTGACAGAGTGATAAATCACCACCAGACAAATACATAACCCTTTGATCTGGTTAATCCATAGCTCTTTTTGTTTCATCAGGACAACACGCTCTTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCgtggtg < 7:562489/138‑1 (MQ=255)
gACCGAGTGATAAATCACCACCAGACAAATACATAACCCTTTGATCTGGTTAATCCATAGCTCTTTTTGTTTCATCAGGACAACACGCTCTTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGTGGTGTAAt < 1:318264/140‑1 (MQ=255)
gAGTGATAAATCACCACCAGACAAATACATAACCCTTTGATCTGGTTAATCCATAGCTCTTTTTGTTTCATCAGGACAACACGCTCTTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGCCGCGTGGTGTAATGCGt > 5:935499/1‑140 (MQ=255)
aGTGATAAATCACCACCAGACAAATACATAACCCTTTGATCTGGTTAATCCATAGCTCTTTTTGTTTCATCAGGACAACACGCTCTTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGTGGTGTAATGCGTa > 3:550986/1‑140 (MQ=255)
aGTGATAAATCACCACCAGACAAATACATAACCCTTTGATCTGGTTAATCCATAGCTCTTTTTGTTTCATCAGGACAACACGCTCTTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGGGGGGTAATGCGTa > 3:31845/1‑140 (MQ=255)
aGTGATAAATCACCACCAGACAAATACATAACCATTTGATCTGTTTAATACATAGATCTTTTTGTTTCATCAGGACAAAACGCTATATTTATATAACATGCGCTTGATACTGCGTAGCGAGTCGCTTGGTGTAATGAGtt > 6:965930/1‑139 (MQ=255)
tGATAAATCACCACAAGACAAATACATAACACTTTGATCTGGTTAATCCATAGCTCTTTTTGTTTAATAAGGACAACACTATCTTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTGAGTGGCGAGTCGCGGGGGGTTATGAGtg > 7:961248/1‑137 (MQ=255)
caccaGACAAATACATAACCCTTTGATCTGGTTAATCCATAGCTCTTTTTGTTTCATCAGGACAACACGCTCTTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGTGGTGTTATGCGTAtctggctggtttt > 5:573279/1‑135 (MQ=255)
aTACATTACCCTTTGATCTGGTTAATCCATAGCTCTTTTTGTTTCATCAGGACAACACGCTCTTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGTGGTGTAATGCGTATCTGTCTGTATTTTGTTAttttt < 4:721950/140‑1 (MQ=255)
aTACATAACCCTTTGATCTGGTTAATCCATAGCTCTTTTTGTTTCATCAAGACAACACGCTCTTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTGCGGGCCGAGTCGCGGGGGGTAAAGGGTATCTGTCTGTATTTGGTTAttttt > 3:765487/1‑140 (MQ=255)
aaCATAACCCTTTGATCTGGTTAATCCATAGCTCTTTTTGTTTCATCAGGACAACACGCTCTTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGTGGTGTAATGCGTATCTGTCTGTATTTGGTTAtttt < 8:439576/137‑1 (MQ=255)
cATAACCCTTTGATCTGGTTAATCCATAGCTCTTTTTGTTTCATCAGGACAACACGCTCTTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGGGGTGTAATGGGTATCTGTCGGTATTTGGTTTTTTTTGAg > 6:945764/1‑140 (MQ=255)
tAACCCTTTGATCTGGTTAATCCATAGCTCTTTTTGTTTCATCAGGACAACACGCTCTTTTTATTTAACATGCGGGTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGGGGTGTAATTCGTATCAGTCTGTTTTTGGTAATTTTTAAGAt > 5:604765/1‑140 (MQ=255)
aaaCCATTTGATCAGGTTAATCCATAGCTCTTTTTGTTTAATCAGGACAACACGCTCTTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTG‑GGGGCGAGGCGCGTGGAGTAATGCGTATCTGTCTGTATTTGGTTATTTTTCAGa < 8:331553/137‑1 (MQ=255)
aaCCCTTTGATCTGGTTAATCCATAGCTCTTTTTGTTTCATCAGGACAACACGCTCTTTATATTTAACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGTGGTGTAATGCGTATCTGTCTGTTATTTGTTTTTTTTAAGAtt > 3:412229/1‑139 (MQ=255)
tttGATCTGGTTAATCCATAGCTCTTTTTGTTTCATCAGGACAACACGCTCTTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGTGGTGTTATGCGTATCTGGCGGGATTTGGTTATTTTTCAGATAAAAAt > 5:523657/1‑140 (MQ=255)
tttGATCTGGTTAATCCATAGCTCTTTTTGTTTCATCAGGACAACACGCTCTTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGTGGTGTAATGCGTATCTGTCTGTATTTGGTTATTTTTAAGATAAatat > 4:979805/1‑140 (MQ=255)
tttGATCTGGTTAATCCATAGCTCTTTTTGTTTCATCAGGACAACACGCTCTTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGGGGTGTAATGCGGATCTTTATGGATTTTGGTTTTTTTCAGATAAAGaa > 2:341569/1‑139 (MQ=255)
ttcaTCTGGTTAATCCATAGATCTTTTTGTATCATCAGGACAACACGCTCTTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGTGGTGT‑ATGCGTATCTGTCTGTATTTGGTTATTTTTCAGATAAAGATCa < 4:240986/137‑1 (MQ=255)
tGATCTGGTTAATCCATAGCTCTTTTTGTTTCATCAGGACAACACGCTCTTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTGCGTGGCGAGTCGCGGGGTGTAATGCATATATTTAAGTATTTGTGTATTTTAAAGATAAAAATCa > 6:65204/1‑140 (MQ=255)
tGATCTGGTTAATCCATAGCTCTTTTTGTTTCATCAGGACAACACGCTCTTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGGTGGGTAATGCGTATCTGTCTGGATTTGGTTTTTTTTAAGATAAAGAt > 8:692926/1‑138 (MQ=255)
tGATCTGGTTAATCCATAGCTCTTTTTGTGTCATCAGGACAACACGCTCTTTTTATTTAACATGCGGGTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGGGGTGTTATGCGTATCGTTCTGTATTTTGTTATTTTTAAGATaaatttaa > 6:301967/1‑135 (MQ=255)
tGATCTGGTTAATCCATAGCTATTTTTTTTTCATCAGTACAAAACGCTATTTTTATTTAACATTCGGTTTATCATGCTGTGCGAGTCGCGTTGTGTAAAGCTTTTATGTATTTATTTTGTTATTTTTAATATAAatataa > 5:333764/1‑138 (MQ=255)
aTCTGGTTAATCCATAGCTCTTTTTGTTTCATCAGGACAACACGCTCTTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGTGGTGTAATGCGTATCTGTCATGATTTGGTTATTTTTCATATAAAGAtaa > 8:323501/1‑136 (MQ=255)
aTCTGGTTAATCCATAGATCTTATTGTTTCATCAGGACAACACGCTCTTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGTTGTGTTATGCGTAAGTGTAGGTATTTTGTTATTTTTCAGCTAAAGATCa > 8:63581/1‑138 (MQ=255)
tGGTTAATCCATAGCTCTTTTTGTTTCATCAGGACAACACGCTCTTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGGGGTGGTATGCGTATCTGTGTGTTTTTTGTTTTTTTTGAGATAAATATAATGccc > 1:102677/1‑139 (MQ=255)
ggTTAATCCATAGCTCTTTTTGTTTCATCAGGACAACACGCTCTTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGTGGTGTAATGCGTATATGTATGTATTTTGTTTTTTTTGATATAAAGATCAGGCcac > 6:205660/1‑140 (MQ=255)
ggTTAATCCATAGCTCTTTTTGTTTCATCAGGACAACACGCTCTTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGTGGGGGAATGCGTATCTGTCTGGATTTTGTTATTTTTCAGATAAAGATCAGGcccc > 6:843385/1‑138 (MQ=255)
ggTTAATCCATAGCTCTTTTTGTTTCATCAGGACAACACGCTCTTTTTAGTTAACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGGGGGGTAATGCGTATCTGTCTGGATTTGGGTTTTTTTCATTTTAATAGCAGGcccc > 2:941359/1‑138 (MQ=255)
gTTAATCCATAGCTCTTTTTGTTTCATCAGGACAACACGCTCTTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGTGGTGTAATGCGTATCTGTCTGTATTTGGTTATTTTTCAGATAAAGATCAGGCcaca < 6:81515/140‑1 (MQ=255)
gTTAATCCATAGCTCTTTTTGTTTCATCAGGACAACACGCTCTTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGTGGTGTAATGCGTATCTGTCTGTATTTGGTTATTTTTCAGATAAAGATCAGGCcaca < 6:376608/140‑1 (MQ=255)
gTTAATCCATAGCTCTTTTTGTTTCATCAGGACAACACGCTCTTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGTGGTGTAATGCGTATCTGTCTGTATTTGGTTATTTTTCAGATAAAGATCAGGCca < 7:818981/138‑1 (MQ=255)
gTTAATCCATAGCTCTTTTTGTTTCATCAGGACAACACGCTCTTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGTGGTGTAATGCGGAAATGTCTGTATTTTGTTATTTTTAAGATAAATATAAGGCcaca > 3:817422/1‑140 (MQ=255)
ttAATCCATAGCTCTTTTTGTTTCATCAGGACAACACGCTCTTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGTGGTGTAATGCGTATATGTCTGTATTTTGGTTTTTTTCAGATAAATATCAGGCcac > 7:908395/1‑138 (MQ=255)
ttAATCCATAGCTCTTTTTGTTTCATCAGGACAACACGCTCTTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGGGGTGTTATGGGTATCTGTCTGTATTTGGTTATTTTTAATATAAATATAAGGcccc > 7:373807/1‑136 (MQ=255)
aTCCATAGCTCTTTTTGTTTCATCAGGACAACACGCTCTTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGTGGTGTAATGCGTATCTGTCTGTATTTGGTTATTTTTCAGATAAAGATCAGGCCACATGGc < 3:723781/140‑1 (MQ=255)
aTCCATAGCTCTTTTTGTTTCATCAGGACAACACGCTCTTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGTGGTGTAATGCGTATCTGTCTGTATTTGGTTATTTTTCAGATAAAGATCAGGCCACATGGc < 5:205660/140‑1 (MQ=255)
tCCATAGCTCTTTTTGTTTCATCAGGACAACACGCTCTTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGTGGGGTAATGCGTATATGTCTGTATTTGGTTTTTTTTCAGATAAACTTAAGGCCCAATGGcc > 6:534166/1‑140 (MQ=255)
caaTAGCTCTTTTTGTTTCATCCGGACCACACGCTCTTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGTGGTGTAATGCGTATCTGTCTGGATTTGGTTATTTTTCAGATAAAGATCAGGCCACATGGCCg < 6:1005028/138‑1 (MQ=255)
aGCTCTTTTTGTTTCATCAGGACAACACGCTCTTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGTGGTGTAAAGCGTATAAGTATGAATATGGTTATTTTTGATCAAAAGAACACGCCACAAGGCCgatta > 1:860219/1‑138 (MQ=255)
aGCTCTTTTTGTTTCATCAGGACAACACGCTCTTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGGGGTGTAATGCGGATCTGTCTGTTTTTTGTTATTTTTCAGATAAATATAACGCCACATGGCCcattt > 3:181497/1‑138 (MQ=255)
aGCTCTTTTTGTTTCATCAGGACAACACGCTCTTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGGGGGATAAATCGTATCTGTCTGTATATGGTTATTTTTCAGATAAATATCAGGCCACATGGCCgatta > 1:699554/1‑138 (MQ=255)
gCTCTTTTTGTTTCATCAGGACAACACGCTCTTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGTGGTGTAATGCGTATCTGTCTGTATTTGGTTATTTTTAAGATAAATATAAGGCCCCATGGCCgatgat > 2:190339/1‑140 (MQ=255)
tttttGTTTCATCAGGACAACACGCTCTTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGTGGTGTAATTCGTATCTGTCTGTATTTGGTTATTTTTAAGATAAATATCAGGCCACATGGCCGATGATaaaa > 2:97704/1‑140 (MQ=255)
tttGTTTCATCAGGACAACACGCTCTTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGTGGTGTAATGCGTTTGTGGCTGTATTTTGTTATTTTTGAGATAAAGATCAGGCCACATGGCCGATGATAAAAtt > 2:1071774/1‑139 (MQ=255)
tGTTTCATCAGGACAACACGCTCTTTTTATTTTACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGTGGTGCAATGCGTATCTGTCTGTATTTGGTTATTTTTCAGATAAAGATCAGGCCACATGGCCGATGATAAAATGAg < 6:690535/140‑1 (MQ=255)
tGTTTCATCAGGACAACACGCTCTTTTTATTTAACATGCGGTTGAGCCTGCGGGGCGAGGCGCGTGGTGTAATGCGTATCTGTCTGTATTTGGTTATTTTTCAGATAAAGATCAGGCCACATGGCCGATGATAAAATGAg < 4:127240/140‑1 (MQ=255)
gTTTCATCATGACAACACGCTCTTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGTGGTGTAATGCGTATCTGTCTGTATTTGGTTATTTTTCAGATAAAGATCAGGCCACATGGCCGATGATAAAATGAgg < 4:1023093/140‑1 (MQ=255)
gTTTCATCAGGACAACACGCTCTTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGTGGTGTAATGCGTATCTGTCTGTATTTGGTTATTTTTCAGATAAAGATCAGGCCACATGGCCGATGATAAAATGAgg < 6:997787/140‑1 (MQ=255)
gTTTCATCAGGACAACACGCTCTTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGTGGTGTAATGCGTATCTGTCTGTACTTGGTTATTTTTCAGATAAAGATCAGGCCACATGGCCGATGATAAAATGAgg < 6:797145/140‑1 (MQ=255)
ttCATCAGGACAACACGCTCTTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGAGTTGTTTAATGCGTTTATGTTTTTATTTGGTTATTTTTAACATAAAGATAAGGCAAAATGTCCGATTATTAAATTAGGcc > 6:523895/1‑139 (MQ=255)
catcctgACAACACGCTCTTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGGCGCGTGGTGTAATGCGTATCTGTCTGTATTTGGTTATTTTTCAGATACAGATCAGGCCACATGGCCGATGATAAAATGAGGCa < 8:567465/132‑1 (MQ=255)
atcaGGACAACACGCTCTTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGTGGTGTAATGCGTATCTGTCTGTATTTGGTTATTTTTTATATAAAGAACAGGCCACATGGCCGATGATAAAATGAGGCAcat > 2:370808/1‑138 (MQ=255)
atcaGGACAACACGCTCTTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGGGGTGTAATGCGGATCTGTCTGTTTTTGGTTATTTTTAAGATAAAGATAAGGCCACATGGCCGATGATAAAATTAGGCACtt > 2:522971/1‑140 (MQ=255)
cacGCTCTTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGTGGGGGTATGCGGATCTGTCGGGATTTGGGTATTTTTAAGATAAACATCACGCCACATGGCCGTTGATTAAATGAGGGCAGTTATCCgattg > 1:1089855/1‑140 (MQ=255)
cacGCTCTTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGGGGTGGAATGCGTATAAGGCTGTATTTGGTTATTTTTAAGATAAACATAAGGCCACAATGCCGATGATAAAAAGAGGCCCATTAGACgattt > 1:1045891/1‑139 (MQ=255)
tctTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGTGGTGTAATGGCTAAATGTCTGTATTTTGTTATTTTTAATAAAAAGATAAGGCCACAAGGCCGATGAAAAAATTAGTCACATTAGACGTTTGAtttt > 1:657563/1‑139 (MQ=255)
tctTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGTGGTGTAATGCGGATCTGTGTGTATTTGGTTATTTTTCAGATAAATATCAGGCCACATGGCCGATGATAAAATTAGGCACTTTAGACGATTGATTTg > 1:26544/1‑140 (MQ=255)
ctTTTTCTTTAACATGCGGTAGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGTGGTGTAATGCGTATCTGTCTGTATTTGGTTATTTTTCAGATAAAGATCAGGCCACCTGGCCGATGATAAAATGAGGCACTTTAGCCGATTGAttt < 7:491859/138‑1 (MQ=255)
ttatttaACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGTGGTGTAATGCGTATCTGTCTGTATTTGGTTATTTTTCAGATAAAGATCAGGCCACATGGCCGATGATAAAATGAGGCACTTTAGCCGATTGATTTGCCGGt < 4:416234/140‑1 (MQ=255)
ttatttaACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGTGGTGTAATGCGTATATGTCTGTATTTGTTTATTTTTAAGATAAAGATACGGCCACATGGCCGATGATAAAATGAGGCACTTTAGCCGATTGATTTGCCGGt > 4:1030930/1‑140 (MQ=255)
tatttaTCATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGTGGTGTAATGCGTATCTGTCTGTATTTGGTTATTTTTCAGATAAAGATCAGGCCACATGGCCGATGATAAAATGAGGCACTTTAGCCGATTGATTTGCCGGTa < 2:1018772/140‑1 (MQ=255)
tatttaACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGGGGTGTAATGCGGATCTGTCTGTATTTGGTTATTTTTCAGATAATGATCAGGCCACATGGCCGATGATAAAATGAGGCACTTTAGCCGATTGATTTGCCGGTa < 6:28903/140‑1 (MQ=255)
tttaACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGTGGTGTAATGCGTATATGTATGTATTTGGTTATTTTTAATATAAATATCAAGCCACATGGCCGAATATAAAATCAGGAACTTTATCCGATTGAATTGTCGGTTCt > 4:653043/1‑140 (MQ=255)
taACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGGGGTGTAATGACAATCAGTCTGTATTTTGTTATTTTTAAGAATAAGCAAAGGCCACATGGACGAGAATAAAATGAGGCCAATTGACCGCATGATTTGCCGGTACgtt > 6:155157/1‑140 (MQ=255)
aaCATGCGGTTGATCCTGCTGGNCGAGTCGCGTGGTGTAATGCGTATCTGTCTGTATTTGGTTATTTTTCAGATAAAGATCAGGCCACAAGGACGATGATAAAATGAGGCACTTTNGCCNATTGATTTGCCGGTACtttt < 3:166051/140‑1 (MQ=255)
aaCATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGTGGTGTAATGCGTATCTGTCTGTATTTGGTTATTTTTCAGATAAAGATCAGGCCACATGGCCGATGATAAAATGAGGCACTTTAGCCGATTGATTTGCCGGTACtttt < 4:469980/140‑1 (MQ=255)
aaCATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGTGGTGTAATGCGTATCTGTCTGTATTTGGTTATTTTTCAGATAAAGATCAGGCCACATGGCCGATGATAAAATGAGGCACTTTAGCCGATTGATTTGCCGGTACtttt < 2:687114/140‑1 (MQ=255)
aaCATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGTGGTGTAATGCGTATCTGTCTGTATTTGGTTATTTTTCAGATAAAGATCAGGCCACATGGCCGATGATAAAATGAGGCACTTTAGCCGATTGATTTGCCGGTACtttt < 2:686158/140‑1 (MQ=255)
aCATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGTGGTGTAATGCGTATCTGTCTGTATTTGGTTATTTTTAAGATAAAGATCAGGCCACAAGGCCGATGATAAAATGAGGCACTTTAGCCGATTGATTTGCCGGTACtttta > 4:990370/1‑139 (MQ=255)
tGCGGGTGATCCTGCGGGGCGTGTCGCGTGGTGTAATGCGTATCTGTCTGTATTTGGTTATTTTTCAGATAAAGATCAGGCGACATGGCCGATGATAAAATGAGGCACTTTAGCCGATTGATTTGCCGGTACTTTTCAGa < 6:761113/140‑1 (MQ=255)
gCGGGTGATCCTGCGGGGCGTGTAGCGTGGTGTAATGCGTATCTGTCTGTATTTGGTTATTTTTCAGATAAAGATCAGGCCACATGGCCGATGATAAAATGAGGCACTTTAGCCGATTGATTTGCCGGTACTTTTCAGAt < 5:664390/140‑1 (MQ=255)
tGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGTGGTGTAATGCGTATCTGTCTGTATTTGGTTATTTTTCAGATAAAGATCAGGCCAAATGGCCGATGATAAAATGAGTCAATTTAGCCGATTGATTTGCCGGTACTTTTCAGATTAg < 8:700470/138‑1 (MQ=255)
ggATCCGGCGGTGCGAGTAGCGTGGTGTAATGCGATTCTTGCTGATTTGGGTTAGTTTTGAGATCAAGATCAGGCCACATGGCCGATGTTATAATGAGGCTCTTTTGCCGATTGATTTGCCGGTACTTTTCAGATTAg < 8:949467/137‑1 (MQ=255)
gATCCTGCGGGGCGAGTCGCGGGGTGGTATGCGTATCTGTCGGTATTTTGTTATTTTTCAGATAAAGATAAGGCCACATGTCCGATGATAAAATGAGGGACTTTAGCCGATTGATTTGCCGGTTATTTTGAGATTATccc > 3:924670/1‑140 (MQ=255)
ccTGCGGGGCGAGTCGCGTGGTGTAATGCGTATCTGTCTGTATTGGGTTATTTTTCAGATAAAGATCAGGCCACATGGCCGATGATAAAATGAGGCACTTTAGCCGATTGATTTGCCGGTACTTTTCAGATTAGCCCTGa < 3:408893/140‑1 (MQ=255)
cTGCGGGGCGAGTCGCGTGGTGTAATGCGTATCTGTCTGTATTTGGTTATTTTTCAGATAAAGATCAGGCCACATGGCCGATGATAAAATGAGGCACTTTAGCCGATTGATTTGCCGGTACTTTTCAGATTAGCCCTGAc < 5:1035598/140‑1 (MQ=255)
gggggCGAGTCGCGTGGTGTAATGCGTATCTGTCTGTATTTGGTTATTTTTCAGATAAAGATCAGGCCACATGGCCGATGATAAAATGAGGCACTTTAGCCGATTGATTTGCCGGTACTTTTCAGATTAGCCCTGACGAt < 3:668145/139‑1 (MQ=255)
cGGGGCGCGTCGCGGGGTGTAATGCGTATCTGTCTGTATTTGTTTATTTTTCAGATAAAGATCAGGCCACATGGCCGATGATAAAATGAGGCACTTTAGCCGATTGATTTGCCGGTACTTTTCAGATTAGCCCTGACg < 7:621788/138‑1 (MQ=255)
cGGGGCGAGTCGCGTGGTGTAATGCGTATCTGTCTGTATTTGGTTATTTTTCAGATAAAGATCAGGCCACATGGCCGATGATAAAATGAGGCACTTTAGCCGATTGATTTGCCGGTACTTTTCAGATTAGCCCTGACGAt < 5:682490/140‑1 (MQ=255)
cGGGGCGAGTCGCGTGGGGTAATGCGTATCTGTCTGTATTTTGTTATTTTTCAGATAAAGATCAGGCCCCATGGCCGATGATAAAATGAGGCACTTTAGCCGATTGATTTGCCGGTACTTTTCAGATTAGCCCTGACGAt < 1:434595/140‑1 (MQ=255)
cGAGTCGCGTGGGGTTATGCGTATATGTCGGTATTTGGTTATTTTTAAGATAAAGATAAGGCCACATGGCCGATGATAAAATTAGGCACGTTTGCCGATTTATTTGCCCGTACTTTTAATATTTTCCCTGCCCATCAcat > 4:326847/1‑138 (MQ=255)
gAGTGGCGGGGTGTTATTCGTATCTGGCTGTATTTGGTAATTTTTCTGATAAAGATCAGGCCACTTGGCCGATTATAAAATGAGGCAGTTTAGCCGATTGTTTTGCCTGTACTTTTCAGATTAGCCCTGACGATCACTTa < 2:300661/140‑1 (MQ=255)
gAGTCGCGTGGTGTAATGCGTATCTGTCTGTATTTGGTTATTTTTCAGATAAAGATCAGGCCACATGGCCGATGATAAAATGAGGCACTTTAGCCGATTGATTTGCCGGTACTTTTCAGATTAGCCCTGACGATCACt < 7:771498/138‑1 (MQ=255)
gAGTCGCGTGGTGTAATGCGTATCTGTCTGTATTTGGTTATTTTTCAGATAAAGATCAGGCCACATGGCCGATGATAAAATGAGGCACTTTAGCCGATTGATTTGCCGGTACTTTTCAGATTAGCCCTGACGATCACt < 7:564707/138‑1 (MQ=255)
gAGTCGCGTGGTGTAATGCGTATCTGTCTGTATTTGGTTATTTTTCAGATAAAGATCAGGCCACATGGCCGATGATAAAATGAGGCACTTTAGCCGATTGATTTGCCGGTACTTTTCAGATTAGCCCTGACGATCACt < 7:395716/138‑1 (MQ=255)
gAGTCGCGTGGTGTAATGCGTATCTGTATGTATTTGGTTATTTTTCAGATAAAGATCAGGCCACATGGCCGATGATAAAATGAGGCACTTTAGCCGATTGATTTGCCGGTACTTTTCAGATTAGCCCTGACGATCACTTa < 3:84425/140‑1 (MQ=255)
gcgTGGTGTAATGCGTATCTGTCTGTATTTGGTTATTTTTCAGATAAATCTCAGTCCACATGGCCGATGATAAAATGAGGCACTTTAGCCGATTGATTTGCGTGTAGTTTTCAGATTAGGCCTGTCGATCTGTTACAGtt < 4:1081033/140‑1 (MQ=255)
gtggtgTAATGCGTATCTGTCTGTATTTGGTTATTTTTCAGATAAAGATCAGGCCACATGGCCGATGATAAAATGAGGCACTTTAGCCGATTGATTTGCCGGTACTTTTCAGATTAGCCCTGACGATCACTTACAGtt < 7:99024/138‑1 (MQ=255)
gtggtgTAATGCGTATCTGTCTGTATTTGGTTATTTTTCAGATAAAGATCAGGCCACATGGCCGATGATAAAATGAGGCACTTTAGCCGATTGATTTGCCGGTACTTTTCAGATTAGCCCTGACGATCACTTACAGtt < 8:507045/138‑1 (MQ=255)
gtggtgTAATGCGTATCTGTCTGTATTTGGTTATTTTTCAGATAAAGATCAGGCCACATGGCCGATGATAAAATGAGGCACTTTAGCCGATTGATTTGCCGGTACTTTTCAGATTAGCCCTGACGATCACTTACAGTTCa < 1:225632/140‑1 (MQ=255)
gtggtgTAATGCGTATCTGTCTGTATTTGGTTATTTTTCAGATAAAGATCAGGCCACATGGCCGATGATAAAATGAGGCACTTTAGCCGATTGATTTGCCGGTACTTTTCAGATTAGCCCTGACGATCACTTACAGTTCa < 5:823084/140‑1 (MQ=255)
gtggtgTAATGCGTATCTGTCTGTATTTGGTTATTTTTCAGATAAAGATCAGGCCACATGGCCGATGATAAAATGAGGCACTTTAGCCGATTGATTTGCCGGTACTTTTCAGATTAGCCCTGACGATCACTTACAGTTCa < 5:935631/140‑1 (MQ=255)
|
GTAATGACCGAGTGATAAATCACCACCAGACAAATACATAACCCTTTGATCTGGTTAATCCATAGCTCTTTTTGTTTCATCAGGACAACACGCTCTTTTTATTTAACATGCGGTTGATCCTGCGGGGCGAGTCGCGTGGTGTAATGCGTATCTGTCTGTATTTGGTTATTTTTCAGATAAAGATCAGGCCACATGGCCGATGATAAAATGAGGCACTTTAGCCGATTGATTTGCCGGTACTTTTCAGATTAGCCCTGACGATCACTTACAGTTCA > NZ_CP022686/4764741‑4765015
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
