Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A9 F2 I0 R1
|
193 |
6708.0 |
8620653 |
98.5% |
8491343 |
136.3 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP022686 |
2,148,115 |
T→G |
13.0% |
L126R (CTG→CGG) |
panF → |
sodium/pantothenate symporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP022686 | 2,148,115 | 0 | T | G | 13.0%
| 258.4
/ 5.0
| 148 | L126R (CTG→CGG) | panF | sodium/pantothenate symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (32/90); new base G (19/5); total (53/95) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.60e-06 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 162 total aligned reads displayed.
GCGATGATTCAGCTTCCTGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGTTGT > NZ_CP022686/2147976‑2148252
|
gCGATGATTCAGCTTCCTGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGtggct > 4:417721/1‑140 (MQ=255)
ttCAGCTTCCTGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGGCTGG‑TGTGGCTGGCg‑agt > 8:106978/1‑140 (MQ=255)
cTTCCTGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCg‑agtttgag < 2:215634/140‑1 (MQ=255)
cTGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑agtttgagtttg < 4:230679/140‑1 (MQ=255)
aGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTgg < 4:675718/140‑1 (MQ=255)
tCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTCTGG‑TGTGGGTGGGG‑AGTTTGTGGTTTCTgggt > 1:35857/1‑138 (MQ=255)
tGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACAAGAGTCGTGTTGTGG‑TGTGGCTGGCG‑TGTTTgtggttggtggttgg > 6:677315/1‑139 (MQ=255)
ggCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGcg < 2:41914/140‑1 (MQ=255)
cTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGGTGcgtt < 4:986692/140‑1 (MQ=255)
ttCGCGCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGcgtt‑cg < 1:74135/140‑1 (MQ=255)
cGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGcgtt‑cgtt < 4:176065/140‑1 (MQ=255)
cGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGcgtt‑cgtt < 6:100341/140‑1 (MQ=255)
cGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGcgtt‑cgtt < 8:473300/140‑1 (MQ=255)
cGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGcgtt‑cgtt < 6:146911/140‑1 (MQ=255)
cGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGcgtt‑cgtt < 2:364684/140‑1 (MQ=255)
cGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCAGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGGATGG‑TTTGGGGGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGGTGggtt‑cgtt > 5:59156/1‑140 (MQ=255)
cGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGGTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGACCTCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGAG‑AGTGTGAGTTTGCTGGTTGcgtt‑cgtt < 2:111572/140‑1 (MQ=255)
gCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTCTGG‑TGTGGGGGGGG‑AGGTTGAGTTTTGTGGTTGcggt‑agttt > 3:215998/1‑139 (MQ=255)
cTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTgg < 2:1053291/140‑1 (MQ=255)
gTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGTGGGGG‑GGTTGGTGGCGTGGTTTTATTTTG‑TGGTTGGGTT‑CGTTGGTggg > 5:476070/1‑138 (MQ=255)
tATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGa < 3:417721/140‑1 (MQ=255)
tctcGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGATGa < 4:711062/140‑1 (MQ=255)
cGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTATGG‑GGTGGCTGGGC‑CGTTTGATTTTGCTGGGTTCGTT‑AGTTGGTGGGATGACCg > 1:911131/1‑140 (MQ=255)
gCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTTAGTTTGCTGGGTGCGTT‑AGTTGGTGCGATGACCGTg > 8:428950/1‑140 (MQ=255)
gCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTATGG‑TGTGGCTGGCG‑ATTTTGAGTGTGCTGGTTGGGTT‑CGTTGGTTCGCTGagccgg > 8:424006/1‑135 (MQ=255)
gCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTGCTGG‑TGTGGCGGGGG‑AGTTTGATTTTGCTGGTTTCGGT‑CGTTTGTGGGATGCCCGTg > 2:217166/1‑140 (MQ=255)
gCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGGGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCGACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGATGACCGTg < 6:551905/140‑1 (MQ=255)
gCAAGAAGTGCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCGACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGATGACCGTg < 6:201288/140‑1 (MQ=255)
cAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTAACAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGATGACCGTGc < 3:973814/140‑1 (MQ=255)
aagaagTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGTTCTGG‑TGTGGGTGGGG‑AGTTTGAGTTTTCTGGGTGCGTT‑CGTTTGGTCGCTGACCGGGCa > 1:1020650/1‑140 (MQ=255)
aagaagTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTGTGG‑TGTGGGGGGCG‑GGTGTGTGTTTGGTGGGTGCGGT‑AGTGGGTGGGATGACCGGGcg > 2:704036/1‑139 (MQ=255)
agaagTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCGGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGATGCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGAGATGACCGTGCAg < 8:1021992/140‑1 (MQ=255)
gCAATTCTTGCGCGCCGCTTCAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATctg < 4:812614/140‑3 (MQ=255)
ccAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATcgg < 7:960820/139‑1 (MQ=255)
ttGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTGGGG‑TGTGGGGGGGG‑AGTTTGTGTTTTGTGGGTGGGTT‑CGGTGGTGGGATGGCCGTGCAGGTTATCGGCGGTggg > 2:576420/1‑138 (MQ=255)
cgcgcCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTgcgcgc < 5:311907/140‑1 (MQ=255)
cgcgcCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTgcgcgc < 1:608821/140‑1 (MQ=255)
ccgcTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTGTGG‑TGTGGGTGGGG‑GGGTTGTTTTTTGTGGGGGGGGG‑AGTTGGTGGGCGGTGCGGGCAGTTTATAGGGGGGGCGCGCcggc > 7:550208/1‑140 (MQ=255)
tGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTATTG‑TGTGGGGGGGG‑AGTTTTTTTTTTGTGGTTGTGTTGCGTT‑GTTCGATGACAGAGGAGTTTTTAGGCCGTACGGCCGTTCTTGAAAccc > 4:294981/1‑139 (MQ=255)
cGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGTTATGG‑TGTGGCGGGCG‑AGGTTGAGTTTGCTGGTTGGGGT‑CGTTGGTGGGCTGCCCGTGGAGTTTATAGGCGGTGCGCGCCGGCTGGAAACcgcg > 4:461380/1‑140 (MQ=255)
cGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTTGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACcgcg < 7:466165/140‑1 (MQ=255)
cGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACcgcg < 5:939948/140‑1 (MQ=255)
cGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACcgcg < 1:187137/140‑1 (MQ=255)
cGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACcgcg < 1:840371/140‑1 (MQ=255)
cGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACcgcg > 4:631097/1‑140 (MQ=255)
cGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTCTGG‑GGTGGGGGGGG‑CGGTTTTGTTTTGTGGGTGGGGT‑GGTTGGGGGGGTGTCCGTGGAGTTTTTCGGCGGGGCGCGGCGGCTGGGAACcgcc > 3:680193/1‑139 (MQ=255)
cGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTATGG‑TGTGGGTGGCG‑CGTTTGAGTTTTCGGGTTGCGGT‑CGGGGGGGCGATGACCGGGGAGTTTTTCGGCGGGGCGCGCCTGCGGGaacacccg > 8:876827/1‑134 (MQ=255)
cGGTGACGCTGAACGATATGCGGCTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACcgcg < 4:939833/140‑1 (MQ=255)
cGGTGACGCTGAACGATATCCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACcgcg < 6:53256/140‑1 (MQ=255)
cGGGGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACcgcg < 1:462607/140‑1 (MQ=255)
tGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGCGTCGTGTTGTGGTTGTGG‑TGGCG‑CGTTTGAGTTTTCGGGGTGGGGT‑GGGTGGGGGGATGAACCTGGAGTTTATATGCGGTGAGCGGCGGCTGGCAACCccggcg > 8:182098/1‑140 (MQ=255)
tGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCgcggcg < 4:706601/140‑1 (MQ=255)
aCGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTGTGG‑GGTGGGGGGCG‑GGGTTGAGTTTGGTGGTTGAGTT‑CGTTGGTGCGATGGCCGGGCATGTTATCGGCGGTGGGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCggg > 8:689022/1‑140 (MQ=255)
aCGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCggg < 6:232144/140‑1 (MQ=255)
gCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGGCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGGGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTa < 2:378318/140‑1 (MQ=255)
cTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGACTCGTCTACTTG‑TTAGGCTGGCG‑AGTTGGATTATGCGGGTTGCGGT‑CGATTGTGAGATGAACCTGGAGATTATCGGCCGGTCGAGCCCGCAGGGAACCGCGGCGGGGAt > 6:862/1‑140 (MQ=255)
gAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTCGGG‑TGTGGGTGGCG‑AGGTTGAGTTTGAGGGTTGGGGT‑GGTTGGGGGGGTGACCGTGGAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCGGCGGGGAAACCCGGCGGGGAttt > 2:190367/1‑139 (MQ=255)
aaCGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCCTCGTGGGG‑TGTGGCTGGCG‑AGGTGGAGGTTGCGGGTTGCTTT‑CGATGGGTCAATGCCCCGTCACTTTATAGGCGGGGCGCTGAGGCTGGAAACACCGGCCGGTATTcc > 8:792539/1‑140 (MQ=255)
gATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTTGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTa < 7:586122/140‑1 (MQ=255)
tatGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑ATTTTGAGTTTGGTGGGTTCGGT‑GGTTTGTTCGATGACCGTGCAGTTTATAGGAGGTGCGCGCCTGCTGGAAACACCGGCGGGTTTTTCTTAtt > 4:233080/1‑139 (MQ=255)
tttGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTGAGG‑TGTGGGGGGGG‑AGTTTGAGTTTTGGGGGTGGGTT‑CGTTGGTGCGCTGAGCGGGGAGTTTATAGGCGGTGCGCCCCCGCTGGAAACCGCGGGCGGGATTACTTATTAAAcacg > 2:833289/1‑137 (MQ=255)
tGCCCGCTACCAGAGTCGTCTGCTGG‑GGTGGCGTGGG‑AGTTTTAGTTTTGTGGTGGCGGT‑CGGTTGTGCGATGCCCGTGCAGGTTATCGGCGGTGCGCGCCGCGAGGTAACCCCGGCGGGGAGTACTTATTTAACCgggg > 6:958828/1‑139 (MQ=255)
cGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGgctgct < 3:773630/140‑1 (MQ=255)
cAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGGGGCGTT‑CGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGAtttt < 2:993504/140‑1 (MQ=255)
tgagTGGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTGGCGGT‑CGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTTCTGATTTTc < 8:52997/139‑1 (MQ=255)
tcgtcgTGTGG‑TGGGGGTGGCG‑AGTTTGTGTTTGCTGGGTGCGTT‑GGGTTGTGCGATGACCGTGCAGTTTATAAGCGGTGGGCGCCAGGGTGAAACCGCCGGGGGGATTAAATATGAAACCGGGCATCGGAttttacgta > 6:207771/1‑135 (MQ=255)
ggtcTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑GGTTGGTGCGATGAGCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCGTGCTGGAAAGCGAGGCGTGTTTTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTAt < 3:357750/139‑1 (MQ=255)
cgtcTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGCGTGTGCTGGTTGCGTG‑CGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTCTCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTAt < 4:595214/140‑1 (MQ=255)
cgtcTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTAt < 1:576420/140‑1 (MQ=255)
cgtcTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGGTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGGTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGGATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTAt < 5:368705/140‑1 (MQ=255)
cgtcTTCGGG‑TGGGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGGTGCGTT‑CGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTAt < 8:326029/140‑1 (MQ=255)
tctGG‑TGTGGCTGGCG‑TGTGTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGGTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 6:893972/140‑1 (MQ=255)
tctGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGTGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTGGGTGCGATTACGGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGACTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 4:878760/140‑1 (MQ=255)
tctGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 8:902248/140‑1 (MQ=255)
tctGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 7:125084/140‑1 (MQ=255)
tctGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGAGGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 8:869719/140‑1 (MQ=255)
atGG‑TTTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTTCGTT‑CGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATAGGCGGTGCGCGCCAGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTACTTATGAAACCCGGCTGCTGATTTTAGGTATCACCAt > 8:408130/2‑140 (MQ=255)
tGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCTTT‑CCTTGGGGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCAtt < 3:287914/140‑1 (MQ=255)
tGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCAtt < 8:223387/140‑1 (MQ=255)
tGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTG‑CGTTGGTGCGATGCCCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCAtt < 4:852862/140‑1 (MQ=255)
tGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGGCGCGGT‑CGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTCTCGGCGGTGCGCGCCGGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTAATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCAtt < 7:464032/140‑1 (MQ=255)
g‑tgtGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTTCGTT‑CGTTGGTTCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTTCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCATATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCAGTATAAGCAATGc > 2:10120/1‑140 (MQ=255)
g‑tgtGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGc > 6:321372/1‑140 (MQ=255)
g‑tgtGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGc > 4:128809/1‑140 (MQ=255)
g‑tgtGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGACGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGc > 3:943400/1‑140 (MQ=255)
tgtgGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCg < 1:1101758/140‑1 (MQ=255)
tgtgGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCg < 2:344259/140‑1 (MQ=255)
tgtgGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCg < 6:563948/140‑1 (MQ=255)
tgtgGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCg < 8:733748/140‑1 (MQ=255)
tgtgGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGGTGCGTT‑CGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCg < 4:1057283/140‑1 (MQ=255)
tgtgGCTGGCG‑AGTTTGAGTGTGCTGGTTGCGTG‑CGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCg < 1:922740/140‑1 (MQ=255)
tgtgGCGGGCG‑AGTTAGAGTTTGCTGTTTGCGTT‑CGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCTGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCg < 6:965118/140‑1 (MQ=255)
ggtgGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCg < 5:685110/139‑1 (MQ=255)
gtgGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGGT‑CGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGGATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGt < 7:548898/140‑1 (MQ=255)
tggctggcG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGtt > 5:264397/1‑140 (MQ=255)
gctggcG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAACCCGCGGCGGGTATTCGTTATGAAACCGGGCTGCTGAGTTTCGGTATCAGCATTGCGTTGt > 7:932294/1‑140 (MQ=255)
gctggcG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCg < 2:645558/136‑1 (MQ=255)
gctggcG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGTTGt > 3:604497/1‑140 (MQ=255)
gctggcG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGAGGCGGGTATACCTTATGAAACCGGGCTGATGATTTTCGGTATCAGCATTGCGttct > 2:928190/1‑138 (MQ=255)
gctggcG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTGGCGTT‑CGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGAGGCGGGTATTCCTTAAGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGTGGt > 7:932298/1‑140 (MQ=255)
|
GCGATGATTCAGCTTCCTGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGG‑TGTGGCTGGCG‑AGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGTTGT > NZ_CP022686/2147976‑2148252
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
