Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A6 F35 I0 R1
|
157 |
6985.9 |
8006972 |
98.3% |
7870853 |
134.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP022686 |
2,148,115 |
T→G |
15.6% |
L126R (CTG→CGG) |
panF → |
sodium/pantothenate symporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP022686 | 2,148,115 | 0 | T | G | 15.6%
| 276.7
/ 9.2
| 167 | L126R (CTG→CGG) | panF | sodium/pantothenate symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (29/106); new base G (28/3); total (58/109) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.98e-13 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 177 total aligned reads displayed.
GATGATTCAGCTTCCTGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCG‑TTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGTTGT > NZ_CP022686/2147978‑2148252
|
tgatTCAGCTTCCTGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTGTGGTGtggctgg > 2:553741/1‑138 (MQ=255)
cTTCCTGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCgagtttg < 6:523922/138‑1 (MQ=255)
cTGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGagtttgagtttg < 7:204390/140‑1 (MQ=255)
gCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGTGCGTGTGTGGCGGGGgaggttgtgtttt > 5:687333/1‑137 (MQ=255)
aGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTgg < 8:614847/140‑1 (MQ=255)
aGTCTGGCTTTCGCGCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCt < 6:962774/138‑1 (MQ=255)
tCTGGCTTTAGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTAGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGATGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCTTCTTCTGGTTTGGAGGGCGAGTTTGAGTTtggtgggt > 7:385704/1‑138 (MQ=255)
ggCGTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGcg < 7:621196/140‑1 (MQ=255)
gCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTATGGTGAGGCAGGGGAGTTTTAGTTTGCTGGtttg > 2:485351/1‑136 (MQ=255)
gCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTCTGGTGTGGGGGGCGAGTTTGAGTTTggtgggtgg > 2:507359/1‑137 (MQ=255)
cTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGcg < 6:809966/138‑1 (MQ=255)
ttCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGcgtg < 5:126779/138‑2 (MQ=255)
cGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGcgttcg < 1:125612/138‑1 (MQ=255)
cGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGcgttcg < 5:462010/138‑1 (MQ=255)
gCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTCTGGGGGGGCTGGCGGGTGTGTGGTTTGTGGGTGcggtag‑ttt > 8:644766/1‑139 (MQ=255)
ggTAGTCTAGGCATGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCAGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCG‑TTGGt < 2:59974/138‑1 (MQ=255)
tATTCTCGGCAAGTAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTAGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCG‑TTGGTGc < 1:49268/138‑1 (MQ=255)
tctcGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCG‑TTGGTGCGAt < 4:499100/138‑1 (MQ=255)
tctcGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCG‑TTGGTGCGAt < 1:211485/138‑1 (MQ=255)
gCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTGGGGGGGGGGGGGCGCGTTTGTGTTTGGTGGTTGCGGTGG‑TTGGTGGGGTGAGCggg > 7:178271/1‑138 (MQ=255)
gCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCG‑TTGGTGCGATGACCg < 1:918264/138‑1 (MQ=255)
gCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCG‑TTGGTGCGATGACCg < 2:727271/138‑1 (MQ=255)
gCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCG‑TTGGTGCGATGACCGTg < 7:760087/140‑1 (MQ=255)
cAAGAAGTTCTCAATTCTGTCGCGAGTCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTTCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTGTGAGTTTGCTGGTTTCGTTCG‑TTGGTGCGATGACCGt < 5:52665/138‑1 (MQ=255)
aagaagTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGTTAGGGGGTGGGGGGCGAGTTTGAGTTTGCGGGTTGGGGTGG‑GTGGGGCGCTGCCCGTg > 6:430368/1‑138 (MQ=255)
aagaagTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTCTGGGGTGGGGGGGGGGGTTTAGTTTGGTGGGTGCGTTGG‑TTGGGGCGATGACCGTg > 3:416788/1‑138 (MQ=255)
gaagTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGTTCTGGGGTGGGGGGGGCGGTTGTGTTTGGTGGTTGGGTTGG‑GTGGTGCGCTGGCCCTggg > 5:428381/1‑136 (MQ=255)
gaagTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTGTGGTGTGGGGGGCGAGGTTTAGTTTTGTGGTTGGGGTGG‑TTGGTGGGAAGAACGGGCa > 3:244790/1‑138 (MQ=255)
tCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCGGGTGTGGCTGGCGAGTTTGTTGTTGCGGGTTTAGTGAG‑TTGGGGGGCTGACCCTGGAGTTTAtt > 8:166958/1‑139 (MQ=255)
cGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTGGGGGGTGGCGGGCGAGGTTGATGTTTTTGGTTGCGGTCGTTTGGTG‑GATGACCGGGCTGTTGATcg > 7:426727/1‑140 (MQ=255)
gCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCG‑TTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATc < 2:795283/138‑1 (MQ=255)
cTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGATGGGGTGTGGGGGGCGAGTTTGTGTTTTGTGGGTGGGGTGG‑TTGGTGGGGTGGCCGGGGAGGTTATagggggg > 3:619359/1‑137 (MQ=255)
ttGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGATCGATATGCTGTTTGCCTGCTACCAGAGTCGTCTAATGGAGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGAGTTCG‑TTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTTTCGGCGGTg < 1:304186/138‑1 (MQ=255)
ttGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTATGGGTGGGCGGGGGAGTTTGAGTTTTCTGGTTTCGTTGG‑TTGGTGGGATGACCGGGCAGTTTATAGGCGGTgcg > 8:914216/1‑140 (MQ=255)
cgcgcCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCG‑TTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTgcgc < 2:188101/138‑1 (MQ=255)
cgcgcCGCTACAATCCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTGTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCG‑TTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTgcgc < 5:24941/138‑1 (MQ=255)
cgccgcTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCG‑TTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTgcgcgc < 1:810321/138‑1 (MQ=255)
ccgcTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGGGTGGTGTGGCGGGCGAGTTTGAGTTTGCGGGTTGGGGTGG‑TTGGTGGGGTGGGCGTGGGGTTTATCGGGGGGGCGCGccg > 6:948440/1‑137 (MQ=255)
ccgcTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTGTGGTGTGGCTGGGGCGTTTGAGTTTGGTTGTTTGGGGAG‑TTGGTGAGAAGCCCGTGCCGTTTTTAGACTGTGCGCGccc > 1:934675/1‑137 (MQ=255)
gCGGTGAGGCTGAACGATCTGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCG‑TTGGTGCTATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAAcc < 5:867796/138‑1 (MQ=255)
gCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCG‑TTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACcgc < 8:39835/140‑1 (MQ=255)
gggTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCGGGTTGCGTTCG‑TTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACcg < 6:687333/137‑1 (MQ=255)
cGGTGACGCTGCACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTCGGGTGTGGGGGGCGAGGTTGAGGGTGCTGGTTGGGGTCG‑GTGGGGCGTGGCCCGGGGAGATTTTAGGGGGGTCGCGCCCGCGGGTCACcgcg > 8:551983/1‑140 (MQ=255)
cGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGTTGTGGTGTGGGTGGGGAGTTTTAGTTTGCTGGGTGCGGTCG‑TTGGTGGGATTCCCGTGCAGTTTTTAGGCGGTGGGCGCCAGCTGGAAACcgcg > 8:670461/1‑140 (MQ=255)
cGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTCTGGTGTGTGGGGCGCGGTTGGGTTTGGTGGGTGGGTTGG‑TTGGTGGGTTGCGCCTGCAGTTTATAGGCCGGGGGCGCCAGCTGGAAAccccc > 8:69760/1‑137 (MQ=255)
cGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTGTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCG‑TTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACcg > 4:743631/1‑138 (MQ=255)
cGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGGGTGGCTGGCGAGTTTTAGTTTGCTTGTTTCGTTCG‑TTGGTGCGCTGACCCTCCAGTTTATCAGCGGTTCGCGACGTCTGGAAAAcgcg > 8:409349/1‑140 (MQ=255)
gTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTTGTGTGTGGCTGGCGTGGTTGATTTTGATGGTTGCGTTGC‑TTGGTGCGATGAACGTGCCGTTTATAGGGGGGGCGCGCCTGCTGGAAACcgcc > 2:320117/1‑137 (MQ=255)
gTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGGTGGCGAGTTTGAGTTTGGTGGTTGCGTTCG‑TTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACcgcg > 2:616162/1‑138 (MQ=255)
gTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGGGAGTTTTAGTTTTGTGGTTGGGGTAG‑GTGGTTCGGTGGCCGTGCAGTTTATCGGCGGTGGGCGCCTGCGGGGAACcgcg > 6:752011/1‑138 (MQ=255)
aCGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGTTCTTGTGTGGGTGGGGAGTTTGTGTTTGCTGGGTGGGTTGG‑TTGGTGCGGTGACCGGGGAGTTTATCGGCGGGGGGCGCCTGCTGGAAACCgcgccg > 4:364179/1‑138 (MQ=255)
aCGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTGTGGTGTTGCTGGCGAGTTTGTGTTTGGTGGTTGCGGTAG‑TTGGTGCGATTACCGGGCAGGTTTTAGGCGGGGCGCGCCGGCTGTGAACCgcggcg > 5:179588/1‑138 (MQ=255)
aCGCTGAACGATAAGCTGTTTGCCCGCTACCCGAGTCGTCTGCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCG‑GTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCggg < 8:301126/140‑1 (MQ=255)
gCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGTTCGGGTGTGGGGGGCGCGTTTGAGTTTGGTGGTTGGGTTGG‑TTGGTGGGATGACCGGGCAGGTTATAGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCCCGGCggg > 4:668472/1‑138 (MQ=255)
gCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCG‑TTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCggg < 5:618760/138‑1 (MQ=255)
gCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTGCG‑TTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCggg < 2:52679/138‑1 (MQ=255)
gCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGGCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCG‑TTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCggg < 4:266492/138‑1 (MQ=255)
tGAACGCTATGCTGTTTGCAACCAACCAGAGTCGTCTTCCGGTGTTGCTGGCGAGTATTAGTTTGCTGGTTGCGTTCG‑TTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGAGGTGCGCGCCTGCTGGAAACAGCGGCGGGTa < 4:446692/138‑1 (MQ=255)
cGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGTTCTGGTGTGGGTGGCGAGGTTGAGTTTGATGGGTGCGGTCG‑TTGGTGGGAATTCCGGGCACTATAAAGGCGGGGCGCCCCAGCTGGTAACCGCCGCCGGTAttac > 4:338250/1‑136 (MQ=255)
gATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCG‑TTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTa < 8:300127/140‑1 (MQ=255)
gATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCG‑TTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTa < 8:304608/140‑1 (MQ=255)
atatGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGTTCTGGGGTGGGGGGCGCGGTTGAGGTTGGAGGGTGCGGGCG‑TTTGGGCGATGGCCCGGGAGGATATACGCGGTGCGCGCCGGGTGGTAACCCCCGCGGGTTTTACatat > 8:424143/1‑140 (MQ=255)
tGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTGTGGGGGGGCGGGCGAGTTTGTGGTTTGTGGGTGCGGTCG‑TTGGTGCGATGACCGGGCGGTGTATAGGCGGGGCGCGCCGGCTGGGAACCGCGGCGGGTATTGCATATGaaa > 2:904226/1‑138 (MQ=255)
cccGCTACCAGAGTCGTCTTGTGGGGTGGGGGGCGCGTTTGAGTTTGGTGGGTGGGTTCG‑GTGGGGCGATGACCGTGCAGTTTTACGGCGGAGCGCGCCTGCAGGAAACCGCGGGGGGTATTGCGTATGAAACCGGgc > 6:138103/1‑138 (MQ=255)
cccGCTACCAGAGGCGGCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTGTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCC‑TTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGgctg < 7:309919/140‑1 (MQ=255)
cGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCG‑TTGGTGCGATGACCGGGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGgctg < 1:387990/138‑1 (MQ=255)
gCTACCAGAGTCGTCGTCTGGTGTGGCTGGGGAGTTTGAGTTTGGTGGGTGGGTTGG‑TTGGTTGGATTACCGTGCAGTTTTTAGGGGGTGCGGGCCTGATGGAAACCGCGGCGGGTATTGCTTATGGAAACGGgcggggg > 8:197662/1‑135 (MQ=255)
ccAGAGTCGTGTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCG‑TTGGTGCGATGTCCGTGCAGTTTAGCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGAt < 6:772463/138‑1 (MQ=255)
cAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCG‑TTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGAtttt < 7:33188/140‑1 (MQ=255)
tcgtcTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCG‑TTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCgg < 5:750187/138‑1 (MQ=255)
ggtcTTCTGGTGTGTCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCG‑TTGGTGCGATGACCGTACAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGt < 1:864116/137‑1 (MQ=255)
cgtcTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTGCG‑GTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGt < 2:403057/138‑1 (MQ=255)
cgtcTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCAGGTTGCGTGCG‑TTGGGGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGt < 4:8660/138‑1 (MQ=255)
cgtcTTCTGGTGTGGCGGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTGCG‑TTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGt < 4:95669/138‑1 (MQ=255)
cgtaTTCTGGTGTGGATGGCGAGTGTGAGTTTGCTGGGTGCGTTCT‑TGGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGt < 5:598766/138‑1 (MQ=255)
cggcttctGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCG‑TTTGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTAt < 8:849559/137‑1 (MQ=255)
tctGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTGG‑TTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 7:834028/140‑1 (MQ=255)
tctGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCG‑TTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAg < 2:28072/138‑1 (MQ=255)
tctGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCG‑TTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGGGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAg < 1:820274/138‑1 (MQ=255)
tctGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCG‑TTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGGGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAg < 3:137987/138‑1 (MQ=255)
tctGGTGTGGCTGGCGAGGTTGAGTTTGCTGGTTGCGTGCG‑TTGGTGCGATGACCGGGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCGGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAg < 3:580806/138‑1 (MQ=255)
tGGTGTGGCTGGCTAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCG‑TTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCAtt < 7:653116/140‑1 (MQ=255)
tGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGTTTGCGTTCG‑GTGGGGCGATGACCGTGCAGTTTAGCGGCGGTGCGCGACTGCTGGAAACCGCGGCGTGGATTCCTTATTACACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 5:413900/138‑1 (MQ=255)
tGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCG‑TTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 4:142191/138‑1 (MQ=255)
tGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCG‑TTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 1:702298/138‑1 (MQ=255)
tGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCG‑TTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCAtt < 7:741403/140‑1 (MQ=255)
tGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCG‑TTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCAtt < 7:914216/140‑1 (MQ=255)
tGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCG‑TTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCAtt < 7:250777/140‑1 (MQ=255)
tGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCG‑TTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGGGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 3:743631/138‑1 (MQ=255)
tGGTGTGGCTGGCGAGTTGGAGTGTGCTGGTTGCGTTCG‑GTGGTGCGATGACCGTGCATTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 5:341146/138‑1 (MQ=255)
gggTGTGGCTGGCGAGGTTGAGTTTGCTGGTTGCGTGCG‑GAGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGTAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 1:439583/137‑1 (MQ=255)
gggTGTGGCTGGCGAGGTGGAGTTTGCTGGTTGCGTTCG‑TTGGTGCTATGACCTTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTTCTTGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 6:266047/137‑1 (MQ=255)
gtgtGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCG‑TTGGTTCCATGACCGTGCACTTTATCAGCGGTGCGCGCCTGCAGGAAACCGCCGCGGGTAATCCTTAAGAAACCCGGCTTCTGAATTTCCGTATCAGCAtt > 6:584866/1‑138 (MQ=255)
tgtgGCTGGCGATTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCG‑TTGGTGCGATGACCGAGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTg < 5:856876/138‑1 (MQ=255)
tgtgGCTGGCGAGTTTGAGGTTGCTGGTTGCGTTCG‑GTGGTGCGATGACCGTGAAGTTTATCGGCGGTGAGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCg < 8:3357/140‑1 (MQ=255)
gtgGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTTCGTTCG‑TTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCAGCTGGAAACCCCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTACGTATCAGCATTGc > 3:141952/1‑138 (MQ=255)
gtgGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCG‑TTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGt < 8:242332/140‑1 (MQ=255)
gtgGCTGGCGAGGTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCG‑TTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGt < 8:293773/140‑1 (MQ=255)
gctggcGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCG‑TTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGtt > 1:156871/1‑138 (MQ=255)
tggcGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCG‑TTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGTTGt > 4:24020/1‑138 (MQ=255)
|
GATGATTCAGCTTCCTGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCG‑TTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGTTGT > NZ_CP022686/2147978‑2148252
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
