Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A8 F35 I0 R1
|
304 |
9232.4 |
10623078 |
98.3% |
10442485 |
135.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP022686 |
2,148,115 |
T→G |
12.9% |
L126R (CTG→CGG) |
panF → |
sodium/pantothenate symporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP022686 | 2,148,115 | 0 | T | G | 12.9%
| 306.1
/ 7.0
| 192 | L126R (CTG→CGG) | panF | sodium/pantothenate symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (47/114); new base G (24/4); total (74/118) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.97e-08 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 209 total aligned reads displayed.
GCGATGATTCAGCTTCCTGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGA‑TGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGTTGT > NZ_CP022686/2147976‑2148252
|
gCGATGATTCAGCTTCCTGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGACAGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGtggct > 2:537175/1‑140 (MQ=255)
cGATGATTCAGCTTCCTGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGtggctg < 2:338128/140‑1 (MQ=255)
cttcaggCAGTCTGGATTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGAAGCTGACCGTTAAGCTGTTTGCCAGCTACCTGATTCGTCACATGCGTTGGCTGGAgagtttg > 4:745918/7‑138 (MQ=255)
cTTCCTGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTAGGGTGTGGCTGGCgcgtttgag > 6:1148509/1‑140 (MQ=255)
tCCTGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTATGGTGTGGCTGGCgagtttgat > 4:104276/1‑137 (MQ=255)
atGCTGTGTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCTCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGATACCAGAGTCTTCTTCTGGTGTGGCTGGCGagtttgagtttg < 2:1332098/139‑1 (MQ=255)
tGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGTTAGTGTGTGGGGGGGGgggttgagtttgg > 2:655997/1‑139 (MQ=255)
tGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTATTCTGGTGTGGGGGTGgagtttgtgttttt > 1:125230/1‑138 (MQ=255)
aGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTgg < 5:23965/140‑1 (MQ=255)
cTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTggtgggtg > 6:849107/1‑140 (MQ=255)
tGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGGGGGGGAGTTTTAGTTTggtgggtgg > 5:1063986/1‑139 (MQ=255)
ggCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTg < 3:299451/138‑1 (MQ=255)
cGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTCGGGTGTGGGTGGGGCGTTTTAGTTTTGTGGTTGagtt‑cgtt > 7:1234808/1‑140 (MQ=255)
cGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGcgtt‑cgtt < 1:53850/140‑1 (MQ=255)
cGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGcgtt‑cgtt < 5:1014559/140‑1 (MQ=255)
cGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGcgtt‑cgtt < 7:833072/140‑1 (MQ=255)
cGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGcgtt‑cgtt < 7:331665/140‑1 (MQ=255)
cGCTCGGTAGTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGGGACGCTGAACGATATGCGGTTTGCCCGCTACCAGAGGCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGcgtt‑cg < 4:49447/138‑1 (MQ=255)
cTCGTTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTgg < 1:460937/140‑1 (MQ=255)
ggTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTTGCTTTTTTTAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTgtgtc < 6:18656/140‑5 (MQ=255)
aTTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCg < 4:436379/138‑1 (MQ=255)
tctcGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTTCCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGA‑TGa < 7:778982/140‑1 (MQ=255)
tctcGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGA‑TGa < 6:990676/140‑1 (MQ=255)
tcGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGGTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGA‑TGAcc < 1:914872/140‑1 (MQ=255)
gCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGA‑TGACCGTg < 6:744811/140‑1 (MQ=255)
agaagTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTAGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGAGCGA‑TGACCGTGCAg < 5:353889/140‑1 (MQ=255)
gaagTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCGGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTTCGTT‑AGTTTGTGCGA‑TGACCGTGCa > 4:1016319/1‑138 (MQ=255)
gaagTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTGTGGTGTTGGGGGCGCGGTTGTGTTTGCGGGGTGCGTT‑CGTTGGTGCGC‑TGGCCGTGcg > 4:1346807/1‑137 (MQ=255)
gaagTTCGCAATTCTTGCGCGACGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGGGGGGCTGGCGGGTTTTTGTTAGCTGGTTGAGGT‑GGTTTGTGGGA‑TGAACCTGCTGt > 7:977184/1‑140 (MQ=255)
gTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGACCGCTACCAGAGTCGTCTTTTGGTGTGGCTGTGGGGTTTGAGTTTGATGGTTGGGTT‑CGTTGGTGCGA‑TGAACCTGAAGtttt > 6:1041886/1‑139 (MQ=255)
tCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTCTGGTGTGGGTGGGGAGTTTGAGTTTGGTGGTTGCGTT‑GGGTGGTGCGA‑TGACCGTGCAGtttt > 4:650271/1‑137 (MQ=255)
ccAATTCGTGCGCGCCGCTACATTGCTGTGACGCTGAACGAAATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTTAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGA‑TGACCGTGCAGTTTATcgg < 6:1247628/139‑1 (MQ=255)
gcgcgcCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTGTGGGGTGGGGGGGGGGTTTGTGTTTTGTGGGTGGGGT‑GGTTGGTGGGG‑TGAACGGGCTGGTTATAGGGGGGgcgcc > 5:558971/1‑139 (MQ=255)
cgccgcTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTTCCCGCTACCAGAGTCGTGTTGTGGAGGGGCTGGCGACTTTGAATTTTAAGGATGTGGT‑CGTTGGTGCGA‑TGAACGTGCAGATTAACGGCGGTTCGCCCct > 2:1307167/1‑140 (MQ=255)
cgccgcTACAATGCGGTGACGCTGAACGATAAGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTCGGGGGTGGCTGGCGCGTTTGAGTTTTCTGGTTGAGTT‑GGGTGGGGCGA‑TGAGCGTCCAGATTATGGGCGGTgccccccg > 8:1050903/1‑134 (MQ=255)
ccgcTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGGTGGCGAGTTTGAGGTTGCTGGGTGCGGT‑CGGTGGTGGGA‑TGACCGGGCAGTTTTTCGGGGGTGCGCGCctgg > 8:927777/1‑139 (MQ=255)
ccgcTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTATGGGGTGGGGGGGGAGGGTGTGGTTGGTGGGTGCGTT‑GGTGGGTGCGAGTCACCG‑GGATTTTATCGGCGGGGGGCGCct > 4:315445/1‑138 (MQ=255)
cgcTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTGAGGGGTGGGGGGGGAGTTTGTGTTTGGGGGGTGGGGG‑GGTTGGGTGGA‑TGACCGTGGAGTTTTTAGGCGGGGCGCGCctgct > 1:291726/1‑140 (MQ=255)
cTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGGGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTGGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGA‑TGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTgg < 8:7072/140‑1 (MQ=255)
aCAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGGTGGGGCGTTTGAGTTTGCTGGGTGCGGT‑GGTTGGTGGGG‑TGACCGGGCAGTTTTTAGGCGGTGCGCGCCtggtgg > 3:793622/1‑138 (MQ=255)
aCAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGGGCGA‑TGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGaa < 8:877317/140‑1 (MQ=255)
tGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGGGGGGGGGGAGGTTGGGTTTGGTGGGTGCGGT‑GGTTGGTGGGT‑TGACCGGGGCGTTTATCGGCGGTGCGCGCCGGCTGGGAACcg > 6:1019419/1‑140 (MQ=255)
gCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCCGAGTCTTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGATTGCTGGTTGCGTT‑AGTTGGTGCGA‑TGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACcgc < 1:98961/140‑1 (MQ=255)
cGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGATCTGGGGTGGGTGGGGAGTTTGATTTTGATGGGTTCGTT‑CGTTTGTGCGA‑TGACCGTGGAGTTTTTAGGCGGTGCGCCCCTGCTGGAAACcgcc > 7:933779/1‑139 (MQ=255)
cGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTGGGGTGGGGGGGGCGAGTGTGAGTTTGGTGGGTGCGGT‑GGGTGGTTCGG‑TGACCGTGGCGTTTATAGGCGGGGCGCGCCGGGGGGCAACcgcg > 8:325706/1‑140 (MQ=255)
cGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGA‑TGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACcgcg < 2:1070736/140‑1 (MQ=255)
cGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTGTGAGTTTGCTGGTTGCGTG‑CGTTGGTGCGA‑TGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACcgcg < 6:1190933/140‑1 (MQ=255)
tGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTGTGGGGGGGGGGGGGGGGTTGAGTTTGGTGGGTGGGGT‑CGTTGGTGGGC‑TGACCGGGGAGTTTTTCGGCGGTGCGCGCCGGCTGGTAACCgcggcg > 5:744129/1‑140 (MQ=255)
tGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTGTGGGGTGGCTGGGGAGTTTTAGTTTTGGGGTTGGGGT‑GGTTGGTGGGG‑TGACCGGGCAGTTTATAGGCGGTGCGCGCCGGCTGGAAACCccggcg > 5:811337/1‑140 (MQ=255)
tGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGA‑TGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTa < 4:539259/138‑1 (MQ=255)
tGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGGGCGA‑TGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTa < 4:129438/138‑1 (MQ=255)
aaCGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTCTTGTGTGGCTGGGGAGTTTGATTTTTCGGGTTGCGTT‑GGTTGGTGCGT‑ATACCGTGCAGTTTATAGGCGGTGCGCGCCTGGTGGCAACAGCGGGGGGGATTca > 2:729068/1‑139 (MQ=255)
tatGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGGTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGA‑TGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATg < 5:424583/140‑1 (MQ=255)
gCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTGGGGGGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTTCTGGGTGCGGT‑CGGTTGTGCGC‑TTACCGTGCAGTTTTTAGGGGGTGCGCGCCTTCTGTTAAACGCGGCGGGTTTTCCTTATTaaa > 6:983740/1‑140 (MQ=255)
gTTTGCCCGCTTCAAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGA‑TGACCGTGCAGGTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCg < 6:883096/140‑1 (MQ=255)
tttGCCCGCTACCAGAGTCGTGGGCGGGTGTGGGTGGCGCGTTTGAGTTTGCGGGGGGGGTT‑GGGTGGTGGGG‑TGACCGTGCAGGTTATCGGGGGGGCGCGCCTGGAGGAAACCCCGGCGGGGTTTACATATGAAAcccg > 8:1102216/1‑138 (MQ=255)
tttGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTGTGGGGGTGCTGGGGCGTTTGAGTTTGGTGGTTGGGTT‑TGTTGGGTCGA‑TGACCGTGCACGTTATAGGCGGTGCGCTGCGTCAGGAAAACGCGGCGGGTATTACGTATGTAAACgg > 8:536801/1‑140 (MQ=255)
tttGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTGTGGTGTGGGTGGCGAGTTTGAGTTTGGTGGTTGGGTT‑GGTTGGTGGGG‑TGACCGTGCAGTTTATAGGCGGGGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGGTTTGCTTATGAAACCgg > 8:651717/1‑140 (MQ=255)
tGCCCGCTACCAGAGTCGTGTTGATGGGTGGGAGGCGAGTTTGAGTTTTCTGGTTGGGTG‑CGTTGGTGGGC‑TGACCGGTGAGTTTTTAGGCGGTGCGCGCCAGCTGGGAACCGCCGCCGGGATAGCATTTGAAAACGGgc > 2:1347598/1‑140 (MQ=255)
tGCCCGCTACCAGAGTCGTGTTATGGGGGTGCCGGCGGGTTTGAGTGTGGAGGGTGCGGT‑AGGTGGGGAGC‑TGACCGATGAGTTTATCTGCGGGGCGCCCGGGCAGGAAACCCCGGCGGGTTTGCCGTAAGaaaacag > 4:11153/1‑134 (MQ=255)
aCCAGAGTCGTCATCTGGTGTGGGTGGCGAGTTTGAGTTTGCAGGTTTCGTT‑GGATTGTGCCA‑TGTCCCAGCAGATTATCGGCGGTGCGCGCCTGCAGGGAACCCCCGCCGGGAATACATAAGAAAACCGGCTGCTGa > 4:601786/1‑138 (MQ=255)
agagTGGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGTGTTGGAGTTTGCTGGGTGCGTT‑CGTTGGTGCGA‑TGACCGTGCAGTTTTTCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCTGGCTGCTGTTTTTc < 2:449322/140‑1 (MQ=255)
agagTCGTCTTCTGGTGTGGCTTGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTG‑CGGTGTTGCGA‑TGACCGTGCAGTTTATCGGCTGTGAGCGCCTGCTGGAATCCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGTGCTGCTGATTTTc < 2:642017/140‑1 (MQ=255)
agagTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGA‑TGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGAttt < 3:539060/138‑1 (MQ=255)
agagGCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGA‑TGACCGTGCAGTTTATCGGCGGGGCGCGCCGGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTc < 8:487947/140‑1 (MQ=255)
gagTCGTCGTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTTAGTTTTCTGGTTGGGTT‑CGTTTGTGCGA‑TGACCGTGCAGTTTATAGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGGGGGGATTCCTTATTAAACCCGGCTGCGGAatttgg > 6:889610/1‑138 (MQ=255)
agTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGGTTGAGTTTTCTGGTTGAGTT‑CTTTGGTGCGA‑TGACCCTGGAGTTTATAGGCCGGGCGCGCCAGCTGGAAACCGCCGCCGGTATTGCTTAATAAAACCGGCTGCTGCttatatg > 8:1183846/1‑135 (MQ=255)
gtcgtcTGCGGGTGGGGTTGGAGAGGTTGAGGTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTTGTGCGA‑TGACCGTTAAGTTTATCGGCTGTGCGCGCCTGCTTGAACCCGCGGAGTGTATTATTTATGAAACCGGGCGGCGGAttggagtt < 8:366193/140‑7 (MQ=255)
gggcttgtGGTGTGGCTGGCGCGTCTTCGGTTGCGGGGTGCGTG‑CGTTGGTGCTT‑TGACAGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGGGACTGCTGGATACCGCGGCGTGTATTGCTTATGAAACCGGGCTGCTGTTTTTAGGTAt < 8:821721/137‑1 (MQ=255)
cgtcTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGA‑TGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGt < 4:816432/138‑1 (MQ=255)
cgtcTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGA‑TGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGt < 3:1295357/138‑1 (MQ=255)
cgtcTTCTGGGGGGGCGGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTGGCGTT‑CGTGGGTCCGA‑TGACCGGGCAGTTAATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTAAGAAACCGGGCTGCGGATTTTCGGt < 4:174011/138‑1 (MQ=255)
cggcttctGGTGTGGCTGTCGATTGTGAGTTTGCTGG‑TGTGTTGCGGTGGTGCGA‑TTCCCTTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTACTTATGACACCGGGCTGCTGATTTTCGGTAt < 5:924522/137‑1 (MQ=255)
agtcTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCGGGCTGCGTT‑CGTTGTGGCGA‑TGACCGTGCAGTTTCTCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAACCCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTGCGGTAt < 6:299691/139‑1 (MQ=255)
tctGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGA‑TGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 7:615465/140‑1 (MQ=255)
tctGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGA‑TGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 1:1134761/140‑1 (MQ=255)
tctGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGA‑TGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 1:770903/140‑1 (MQ=255)
tctGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGA‑TGACCGCGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 7:194191/140‑1 (MQ=255)
tctGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGA‑TGAACGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAg < 4:1205385/138‑1 (MQ=255)
tctGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGAGTT‑CGTTGGTGCGA‑TGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 2:795892/140‑1 (MQ=255)
tctGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGGTGCGGT‑CGTTGGTGCGA‑TGACCGTGCAGTTTATCGGCGGGGCGCGCCGGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCGTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAg < 4:954867/138‑1 (MQ=255)
tctGGTGTGGATGGTGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGA‑TGACCGTGCAGTTTATCGGCTGTGCGCGCCTGCTTGAAACCGCGGCGGTTATTCATTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGTTATCAGCa < 7:448660/140‑1 (MQ=255)
aagggggtgGCTGGGGAGTTTGATTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGA‑GGACCGTGGATTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTAGGTATCAGCa < 5:963872/134‑1 (MQ=255)
tGGTGTGGCTGGCGAGTTTGATTTTGCTGGTTTCGTT‑CGTTGTTGCCA‑TGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCAtt < 7:1137051/140‑1 (MQ=255)
tGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTTCGTT‑CGTGGGTGCGA‑TGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGTGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCAtt < 2:94300/140‑1 (MQ=255)
tGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGA‑TGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCAtt < 7:282363/140‑1 (MQ=255)
tGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGA‑TGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCAtt < 2:1278250/140‑1 (MQ=255)
tGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGATTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGA‑TGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 3:155039/138‑1 (MQ=255)
ggttgtgGCTGGCTAGTTGGAGTTTGCTGGTTGAGTT‑CTTTGGGGCGA‑TGACAGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCTCCTGCTTGAAACCGTGGCGGGTATTCCTTATGAAACCTGTCTGCTGATTTTCGGTTTGAGCAtt < 8:264215/137‑1 (MQ=255)
gggTGTGGCTGGCGTGTTTGAGTTTGCGGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGA‑TGTCCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGATACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 3:11153/137‑1 (MQ=255)
tgtgGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGA‑TGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCg < 7:495762/140‑1 (MQ=255)
tgtgGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGA‑TGACCGTGCAGTTTATCGGCGGGGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCg < 1:655997/140‑1 (MQ=255)
ggtgGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCGGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGA‑TGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCTGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCg < 8:224545/139‑1 (MQ=255)
ggtgGCTGGCGAGTGTGAGTTTGCTGGTTGATTT‑CGTTGGTGCGA‑TGACCGTTCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTg < 4:60848/137‑1 (MQ=255)
ggtgGCGGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGA‑TGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTg < 3:868279/137‑1 (MQ=255)
gtgGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGGTGCGTT‑CGTTGGTGCGA‑TGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGt < 1:1094224/140‑1 (MQ=255)
gtgGCTGGCGAGTTTGAGGTTGCTGGGTTCGGT‑CGTTGGGGCGA‑TGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGt < 6:571960/140‑1 (MQ=255)
tggctggcGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGA‑TGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGtt < 7:270569/140‑1 (MQ=255)
tggctggcGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGA‑TGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGtt > 6:378273/1‑140 (MQ=255)
tggctggcGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGA‑TGACCGTGCAGTTTATCGGAGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGCCTGATGATTTTCGGTATAAGCATTGCGtt > 5:140996/1‑140 (MQ=255)
|
GCGATGATTCAGCTTCCTGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTT‑CGTTGGTGCGA‑TGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGTTGT > NZ_CP022686/2147976‑2148252
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
