Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A9 F13 I0 R1
|
203 |
11425.2 |
8793538 |
98.4% |
8652841 |
135.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP022686 |
2,148,115 |
T→G |
13.6% |
L126R (CTG→CGG) |
panF → |
sodium/pantothenate symporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP022686 | 2,148,115 | 0 | T | G | 13.6%
| 220.3
/ 5.0
| 143 | L126R (CTG→CGG) | panF | sodium/pantothenate symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (31/84); new base G (22/2); total (57/86) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.29e-09 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 155 total aligned reads displayed.
GCGATGATTCAGCTTCCTGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGTTGT > NZ_CP022686/2147976‑2148252
|
gatgatTCAGCTTCCTGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGtggcggg > 7:658763/1‑140 (MQ=255)
atgatTCAGCTTCCTGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCTAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGtggctg < 3:740083/138‑1 (MQ=255)
atgatTCAGCTTCCTGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGtggctg < 3:740088/138‑1 (MQ=255)
tgatTCAGCTTCCTGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGAAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCCGTGACGCTGAAGGATATGATGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGTTCTGGGGGGGCTGGCg > 2:435629/1‑140 (MQ=255)
cAGCTTCCTGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCgagttt < 8:983702/140‑1 (MQ=255)
cTTCCTGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCgagtttgag < 6:890625/140‑1 (MQ=255)
tCCTGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGTTCTGGGGTGGGGGGCgagtttgag > 4:352067/1‑138 (MQ=255)
tGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCACGATACCAGAGTCGTGGTCTGGTGTGGGTGGCGcggtttcgtttgg > 7:660482/1‑139 (MQ=255)
tCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGTAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCGCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGtt < 5:185612/140‑1 (MQ=255)
tCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGtt < 2:725462/140‑1 (MQ=255)
tCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTAGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTAATGTTTGGCTGTGGAGTTTTAGTTTTATGGtt > 6:648284/1‑140 (MQ=255)
ggCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTg < 3:1072975/138‑1 (MQ=255)
gCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTCTGGGGGGGGTGGGGAGTTTGTGTTTGGGGGTTgggg > 1:821169/1‑137 (MQ=255)
ctgtCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGACGTCATCTGGTGTGGCAGGGGAGATAGATTTTGCTGGTTGcgtt > 6:816963/4‑140 (MQ=255)
cGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGcgttcgtt < 2:418400/140‑1 (MQ=255)
cGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGcgttcg < 4:90828/138‑1 (MQ=255)
cGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGATTGCTGGTTGcgttcg < 4:642412/138‑1 (MQ=255)
tCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGTTCTGGTGGTGGTGGGGAGTTTTAGTTTGGTGTGTGggttcgttt > 3:521549/1‑137 (MQ=255)
tATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGa < 1:307181/140‑1 (MQ=255)
aTTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTGGGGTGTGGCTGGCGGGTGTGAGGTTTCTGGGTTGGTTCGTTgggggg > 3:291980/1‑134 (MQ=255)
tctcGTCAAGAAGTTCGGAATTCTTGCGCGACTCTACAATGCGGTTAAGCTTAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTATTATTCTTTTGTGGCTGTCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGa < 6:435755/140‑1 (MQ=255)
tctcGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGCTATGCTGGTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGa < 6:38986/140‑1 (MQ=255)
tctcGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGa < 1:1061484/140‑1 (MQ=255)
cGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGCCGCTGAACGATCTGCTGTTTGCCCGCTACCAGCGGCGTGGTCTGGGGTGGGTGGCGAGGTTGAGGTGTGTGGGTTCGGTCTTTGGTGCGATGACCg > 6:376125/1‑140 (MQ=255)
cGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCg < 2:870072/140‑1 (MQ=255)
gCACGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACACTGCGGTGACGCTGTACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGGTCGTTGGTGCGATGACCg < 3:19371/138‑1 (MQ=255)
gCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCg < 3:778484/138‑1 (MQ=255)
gCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTg < 6:187341/140‑1 (MQ=255)
gCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTg < 8:167618/140‑1 (MQ=255)
gCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGGTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTg < 5:411831/140‑1 (MQ=255)
gCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTCTGGTGTGGCTGGCGAGGTTGATTTTGGTGGTTGGGGTGGTGTGTGGGATGAccc > 3:230383/1‑137 (MQ=255)
gCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGACGTCTGGGGGGGGAGGCGCTTTTGAGTTTGCAGGTTGCGGTCGTGGGTGGGATGACCGTg > 8:43679/1‑140 (MQ=255)
gCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGGTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTg < 2:313210/140‑1 (MQ=255)
aagaagTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGTTCTGGTGTGGGTGGGGAGTTTGAGGTTGGTGGTTGCGTTTGTTGGTGCGGTGACCGTg > 3:1059368/1‑138 (MQ=255)
aagaagTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTCTGGGGTGGGGGGCGCGTTTGAGGTTGGGGGGTGGGTTGGTTGGGGGGCTGCCCGTggg > 5:514556/1‑138 (MQ=255)
aagaagTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTCTGGGGTGGCGGGGGAGTTTTAGTTTGGTGGTTGCGTTCGGTGGTGGGATTACCGTgga > 6:77859/1‑138 (MQ=255)
tCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTTCCAGAGTCGTGGTCTTGGGTTGGGGGGGAGTTTGTGTTTGGTTGTTGGGGTGGGTGGTGGGATGACCGTGGAGtttgta > 7:824456/1‑137 (MQ=255)
gCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATcgg < 8:770625/140‑1 (MQ=255)
gCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATAAGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGCGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATc < 4:1025537/138‑1 (MQ=255)
ttCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTGTGGTGTGGGGGGGGGGTTTTAGTTTGGTGGTTGGGGTGGTTGGGGGGCTGACCGTGCAGGTTTTaggcggg > 5:844872/1‑139 (MQ=255)
cgcgcCGCTACAATGCGGTGACGCTGATCGATATGCTGTTTGCCCGCTACCATAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTgcgcgc < 1:689794/140‑1 (MQ=255)
cgcgcCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTgcgc < 4:995287/138‑1 (MQ=255)
cgcgcCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGGCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTgcgcgc < 2:1053085/140‑1 (MQ=255)
gcgcCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGcc < 7:28447/140‑1 (MQ=255)
gcTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTGGGGTGTGGGAGGGGGGTTTGAGTTTTCTGGGTGGGTTCGTTTGGGCGATTACCGTGCAGTTTTTCGGCGGGGGGCGcccgg > 3:703683/1‑135 (MQ=255)
cTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGGGGGGTGTGGGGGGGGGGGTTGTGTTTGGTGGTTGGGTTGGTTGGTGCGTTGTCCCTGGAGTTTTTGCGCGGTGGGCGGCGGCTgg > 2:109903/1‑140 (MQ=255)
tGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTCTGGTGTGGGGGGCGAGTTTGTGTTTGGTGGTTGCGTTCGTTGGTGGGATGACCGTGCAGTTTATAGGCGGGGCGCGCCTGCTGGGAAccc > 6:946512/1‑139 (MQ=255)
cGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTCTGGTGTGGGGGGCGGGGTTGAGTTTGCTGGTTGGGGTGGGTGGTGGGATGCCCGTGGAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCGGCTGGCAAccccc > 5:1073463/1‑137 (MQ=255)
cGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACcg < 4:864795/138‑1 (MQ=255)
cGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTCTGGTGTGGCTGGGGAGTTTGAGTTTGCGGGTTGGGTTCGTTTGTGCGATGACCGTGGAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCGGCTGGCAACcccg > 2:1093425/1‑140 (MQ=255)
cGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGGCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACcg < 3:252816/138‑1 (MQ=255)
gTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGGGAGTTTGAGTTTTGTGGTTGCGGTCGTTGGTGCGATGTCAGTGGAGTTTATAGGCGGTTCGCGCCTGCTGGAAACCccggg > 1:601665/1‑139 (MQ=255)
gTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGGGTGGTGGGGGTGGCGAGTTTGAGTTTGGTGGTTGGGGTCGTTGGTGGGATGCCCCTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCGGGAAACcgcg > 3:666989/1‑138 (MQ=255)
gTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGGCGTCGGGTGGTGTGGGGTGCGGGGTTGAGTTTGGTGGGTGCGTGGTGTGGTGCGGTGTGCGGGGAGTTTATCGGCGGGGCGCGCCGGGAGGGAACCccggg > 8:879911/1‑139 (MQ=255)
tGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTCTGGTGTGGCGTGCGCGTTTGATTTTGCTGGTTGGGTTGGTTGGTGCGGTGACCGGGCAGTTTATCGGCGGGGCGCGCCTGCTGGAAAACgcggcg > 8:775232/1‑140 (MQ=255)
tGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTCTGGTGTGGCGGGCGAGTGTGAGTTTGGTGGTTGCGGTGGTTGGTGCGATGACCGGGCAGGTTATAGGCGGGGCGCGCCAGCTGGAAACCgcggcg > 1:745984/1‑140 (MQ=255)
aCGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTCCCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGCCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGGTGGAGCGATGACCGTGCAGATTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCggg < 2:565350/140‑1 (MQ=255)
aCGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCggg < 6:596178/140‑1 (MQ=255)
cGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGTGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGt < 7:452521/140‑1 (MQ=255)
tGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTAtt < 1:83516/140‑1 (MQ=255)
gAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTTGTGTGGATGGGGAGTTTGAGTTTTCAGGTTTGGGTCGTTGGTGCGATGCACCTGGAGTTTATAGGGGGTGCGCCCCTGCTGGATAACGCGGCGGGGAt > 4:189587/1‑138 (MQ=255)
aaCGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTATGGTGTGGCTGGGGAGTTTGTGTTTTCTGGTTTGGTTAGTTGGTGAGATGACCGTGCAGTTTATAGGCGGTGCGCGCCGGCTGGAAACCGCGGCGGGTAttgc > 5:605448/1‑138 (MQ=255)
tatGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTGTGGTGTGGGTGGCGAGGTTGAGTTTGGTGGGGGCGTTCGTTGGTGCGGTGACCGTGCAGGTTATCGGCCGTGCGCGCCGGCTGGAAAACGCGGCGGGGATTACTTaag > 2:1052787/1‑138 (MQ=255)
gTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGGTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCg < 8:5594/140‑1 (MQ=255)
tttGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTCTGGGGTGGCGGGGGAGTTTGTGTTTGCTGGGTGGGTGGGTTGGTGGGAGGACCGGGCCGTTTATAGGCGGGGCGCGCCGGCTGGCAACCGCGGCGGGGTTTGCTTTTGGAAcccg > 2:834190/1‑138 (MQ=255)
tttGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCAGGTGTGGCGGGCGAGTTTTAGTTTTGTGGGTTGGGTGGGTGGTGCGATGACCGGGCAGGTTATAGGCGGTGGGCGCCTGCGGGTAACCGCGGCGGGGATTGATTATTGAAcc > 4:808804/1‑138 (MQ=255)
tGCCCGCTACCAGAGTCGTGTTCGGGTGTGGGGGGCGCGTGTGAGTTTGCGGGGTGCGGTGGGTGGTGGGGTGCCCGTGCAGTGTTTCGGCGGTGCGCGCCGGCTGGGAACCGCGGGGGGTTTTACATTTTAACCCGGgc > 8:630209/1‑140 (MQ=255)
tGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTGTGGTGTGGGTGGCGAGTTTTTGTTTGGTGGTTGGGGTCGTTGGTGGGATGACCGTGCAGTTTATAGGCGGTGCGCGCCGGCTGGAAACCGCGGCGGGGATTGCTTATTAAAcccg > 4:425324/1‑136 (MQ=255)
cccGCTACCAGAGTCGTCTTCGGGTGTGGGTGGGGAGTTTGAGTTTGGTGGTTGGGTTGGTTGGTGCGATGTCCGTGCAGTTTATAGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGgc > 4:530963/1‑138 (MQ=255)
cTACCAGAGTCGTCTTCTGGGGTGGGTGGGGAGTTTGAGTTTGGTGGTTGGGGTCGTTGGTGGGATGGCCGGGCAGTTTATAGGCGGTGCGCGCCGGCTGGAAACCGCGGCGGGGATTCCGTATTAAAACGGGctgctgt > 6:1043861/1‑139 (MQ=255)
ccAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGGTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGAttt < 5:984888/140‑1 (MQ=255)
cgtcTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGt < 4:666989/138‑1 (MQ=255)
cgtcTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTAt < 1:1099662/140‑1 (MQ=255)
cgtcTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGGTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGt < 3:986928/138‑1 (MQ=255)
tctGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 2:914106/140‑1 (MQ=255)
tctGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGGGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCGGCTGGAACCCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 5:598102/140‑1 (MQ=255)
tctGGTGTGGCGGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGGTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 8:484674/140‑1 (MQ=255)
tctGGTGTGGATGGGGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTTGTGCGATGACAGTGGTGTTTATAGTCGGTGAGCGACTGCTGGAAACCGCGGCGTGTTTTCCTTATGAAACCGGGCTGATGATTTTCGGTATCAGCa < 2:29352/140‑1 (MQ=255)
gctGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTAGCTGGTGGCGTTGGTTGGTGCGATGACCTGGCAGGTTATCGGCGGTGCGCGACTGCTGGAACCCTCGGCGGGTATTCCTTATGACTCCTGGCTGCTGATTTTCGGTATCAg < 4:115716/137‑1 (MQ=255)
tGGTGTGTCTGGCGAGTTTGAGTTGGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCAtt < 6:552406/140‑1 (MQ=255)
tGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCAtt < 5:184574/140‑1 (MQ=255)
tGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCAtt < 5:673696/140‑1 (MQ=255)
tGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCAtt < 1:499648/140‑1 (MQ=255)
gtgtGGCTGGCGAGATTTAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTTGTTCGATGACCGTGCAGTTTATCTGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGTGTATTCCTTATGATACCGGGCTGCTGATTTTAGCTATCACCAATGc > 8:944437/1‑140 (MQ=255)
tgtgGCTGTCGATTTTGAGTTTGCTGGTTGCGATCGTTGGTGCGATGACAGTGCAGTTTATCGGCGGTGAGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTg < 3:26272/138‑1 (MQ=255)
tgtgGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCg < 6:486122/140‑1 (MQ=255)
tgtgGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCg < 5:275309/140‑1 (MQ=255)
tgtgGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCg < 6:26808/140‑1 (MQ=255)
tgtgGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTGCGTTGGTGCGATTACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCg < 7:1024333/140‑1 (MQ=255)
tgtgGCTGGCGAGTTTGAGTGTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCg < 6:141201/140‑1 (MQ=255)
ggtgGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTg < 3:425324/137‑1 (MQ=255)
ggtgGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTGCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTg < 4:944726/137‑1 (MQ=255)
ggtgGCTGGCGAGTTGGAGTTTGCGGGTTGCGGTCGTTGGTGCGATGACCGGGCAGGTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGGATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTGCGGTATCAGCATTGCg < 1:214156/139‑1 (MQ=255)
gtgGCTTGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGAGCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCGGCGGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGt < 6:634299/140‑1 (MQ=255)
gtgGCTGGCGAGTTTGATTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGAAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGt < 8:265035/140‑1 (MQ=255)
gtgGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGt < 1:956779/140‑1 (MQ=255)
tggctggcGAGTTTGAGTTTGCTGGTTTCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCAATGCGtt > 7:803423/1‑140 (MQ=255)
gctggcGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATcgg < 2:967205/60‑1 (MQ=255)
gctggcGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAACCCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGTTGt > 8:463414/1‑140 (MQ=255)
gctggcGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGtt > 3:1029846/1‑138 (MQ=255)
|
GCGATGATTCAGCTTCCTGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGTTGT > NZ_CP022686/2147976‑2148252
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
