Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A23 F22 I1 R1
|
19 |
64.2 |
2479524 |
91.1% |
2258846 |
141.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
754,446 |
A→G |
L8P (CTC→CCC) |
gltA ← |
citrate synthase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 754,446 | 0 | A | G | 96.8%
| 181.1
/ NA
| 64 | L8P (CTC→CCC) | gltA | citrate synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (30/31); minor base C (2/0); total (32/32) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.92e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GCAGGATGCGGTTGAAGTGAAGCCTGGGTCAAAGGTGAACACACCTTTTGAACCGAGAGTACGGATATCAATAACATCTTGACCCAGCGTGCCTTTCAGCACATCCAGTTCAACAGCTGTATCCCCGTTGAGGGTGAGTTTTGCTTTTGTATCAGCCATTTAAGGTCTCCTTAGCGCCTTATTGCGTAAGACTGCCGGAACTTAAATTTGCCTTCGCACATCAACCTGGCTTTACCCGTTTTTTATTTGGCTCGCCGCTCTGTGAAAGAGGGGA > NC_000913/754310‑754583
|
gCAGGATGCGGTTGCAGTGAAGCCTGGGTCAAAGGTGAACACACCTTTGGAACCGAGAGTACGGATATCAATAACATCTTGACCCAGCGTGCCTTTCAGCACATCCAGTTCAACAGCTGTATCCCCGTTGAGGGTGGGTTTTg < 1:963360/143‑1 (MQ=255)
cAGGATGCGGTTGAAGTGAAGCCTGGGTCAAAGGTGAACACACCTTTTGAACCGAGAGTACGGATATCAATAACATCTTGACGCAGCGTGCCTTTCAGCACATCCAGTTCAACAGCTGTATCCCCGTTGAGGGTGGGTTTTGc > 1:317856/1‑143 (MQ=255)
gATGCGGTTGAAGTGAAGCCTGGGTCAAAGGTGAACACACCTTTTGAACCGAGAGTACGGATATCAATAACATCTTGATCCAGCGTGCCTTTCAGCACATCCAGTTCAACAGCTGTATCCCCGTTGAGGGTGGGTTTTGCttt > 1:346986/1‑143 (MQ=255)
gATGCGGTTGAAGTGAAGCCTGGGTCAAAGGTGAACACACCTTTTGAACCGAGAGTACGGATATCAATAACATCTTGACCCAGCGTGCCTTTCAGCACATCCAGTTCAACAGCTGTATCCCCGTTGAGGGTGGGGTTTGCttt > 2:653229/1‑143 (MQ=255)
aTGCGGTTGAAGTGAAGCCTGGGTCAAAGGTGAACACACCTTTTGAACCGAGAGTACGGATATCAATAACATCTTGACCCAGCGTGCCTTTCAGCACATCCAGTTCAACAGCTGTATCCCCGTTGAGGGTGGGTTTTGCtttt < 1:505749/143‑1 (MQ=255)
aTGCGGTTGAAGTGAAGCCGGGGTCAAAGGTGAACACACCTTTTGAACCGAGAGTACGGATATCAATAACATCTTGACCCAGCGTGCCTTTCAGCACATCCAGTTCAACAGCTGTATCCCCGTTGAGGGTGGGTTTTGCtttt < 2:480208/143‑1 (MQ=255)
gCGGTTCCAGTGAAGCCTGGGTCAAAGGTGAACACTCCTTTTGAACCGAGAGTACGGATATCAATAACGTCTTGACCCACCGGGCCTTTCAGCACATCCAGTTCAACAGCTGTATCCCCGTTGAGGGTGGGTTTTGCTTTTGt < 2:813175/143‑1 (MQ=255)
cGGTTGAAGTGAAGCCTGGGTCAAAGGTGAACACACCTTTTGAACCGAGAGTACGGATATCAATAACATCTTGACCCAGCGTGCCTTTCAGCACATCCAGTTCAACAGCTGTATCCCCGTTGAGGGTGGGTTTTGCTTTTGTa > 2:465698/1‑143 (MQ=255)
ggTTGAAGTGAAGCCTGGCTCAAAGGTGAACACACCTTTTGAACCGAGAGTACGGATATCAATAACATCTTGACCCAGCGTGCCTTTCAGCACATCCAGTTCAACAGCTGTATCCCCGTTGAGGGTGGGTTTTGCTTTTGTAt < 1:740162/143‑1 (MQ=255)
ttGAAGTGAAGCCTGGGTCAAAGGTGAACACACCTTTTGAACCGAGAGTACGGATATCAATAACATCTTGACCCAGCGTGCCTTTCAGCACATCCAGTTCAACAGCTGTATCCCCGTTGAGGGTGGGTTTTGCTTTTGTATCa < 2:777923/143‑1 (MQ=255)
ggtgaagCGTGGGTCAAAGGTGAACACACCTTTTGAACCGAGAGTACGGATATCAATAACATCTTGACCCAGCGTGCCTTTCAGCACATCCAGTTCAACAGCTGTATCCCCGTTGAGGGTGGGTTTTGCTTTTGTATCAGCCa < 2:272164/142‑1 (MQ=255)
aagCCTGGGTCAAAGGTGAACACACCTTTTGAACCGAGAGTACGGATATCAATAACATCTTGACCCAGCGTGCCTTTCAGCACATCCAGTTCAACAGCTGTATCCCCGTTGAGGGTGGGTTTTGCTTTTGTATCAGCCATTTa > 1:879342/1‑143 (MQ=255)
ggctaggTCAAATGTGAACATCTCTTTTGCACCGTGAGTACGGATATCAATAACATCGTGACGCAGCGTGCCTTTCAGCACATCCAGGTCAACAGCTGTATCCACGTTGAGGGTGTGTTTTGCTTTTGTATCAGCCATTTAAg < 1:158360/138‑1 (MQ=255)
ccTGGGTCAAAGGTGAACACACCTTTTGAACCGAGAGTACGGATATCAATAACATCTTGACCCAGCGTGCCTTTCAGCACATCCAGTTCAACAGCTGTATCCCCGTTGCGGGTGCGTTTTGCTTTTGTATCAGCCATTTAAgg > 2:691459/1‑143 (MQ=255)
tGGGTCAAAGGTGAACACACCTTTTGAACCGAGAGTACGGATATCAATAACATCTTGACCCAGCGTGCCTTTCAGCACATCCAGTTCAACAGCTGTATCCCCGTTGAGGGTGGGTTTTGCTTTTGTATCAGCCATTTAAGGtc > 1:820906/1‑143 (MQ=255)
tGGGTCAAAGGTGAACACACCTTTTGAACCGAGAGTACGGATATCAATAACATCTTGACCCAGCGTGCCTTTCAGCACATCCAGTTCAACAGCTGTATCCCCGTTGAGGGTGGGTTTTGCTTTTGTATCAGCCATTTAAGGtc > 1:754474/1‑143 (MQ=255)
ggTCAAAGGTGAACACACCTTTTGAACCGAGAGTACGGATATCAATAACATCTTGACCCAGCGTGCCTTTCAGCACATCCAGTTCAACAGCTGTATCCCCGTTGAGGGTGGGTTTTGCTTTTGTATCAGCCATTTAAGGtctc < 2:887614/143‑1 (MQ=255)
tCAAAGGTGAATACACCTTTTGAACCGAGAGTACGGATATCAATAACATCTTGACCCAGCGTGCCTTTCAGCACATCCAGTTCAACAGCTGTATCCCCGTTGAGGGTGGGTTTTGCTTTTGTATCAGCCATTTAAGGTCTCCt < 2:769206/143‑1 (MQ=255)
ccAAAGGTGCACACACCTTTTGAACCGAGAGTACGGATATCAATAACATCTTGACCCAGCGTGCCTTTCAGCACATCCAGTTCAACAGCTGTATCCCCGTTGAGGGTGGGTTTTGCTTTTGTATCAGCCATTTAAGGTCTCCt < 2:474093/142‑1 (MQ=255)
aaCTCACCTTTTGAACCGAGAGTACGGATATCAATAACATCTTGACCCAGCGTTCCTTTCAGCACATCCAGTTCAACAGCTGTATCCCCGTTGAGGGTGGGTTTTGCTTTTGTATCAGCCATTTAAGGTCTCCTTAGCGCCtt < 1:272669/143‑1 (MQ=255)
cacacCTTTTGAACCGAGAGTACGGATATCAATAACATCTTGACCCAGCGTGCCTTTCAGCACATCCAGTTCAACAGCTGTATCCCCGTTGAGGGTGGGTTTTGCTTTTGTATCAGCCATTTAAGGTCTCCTTAGCGCCTTAt > 1:578361/1‑143 (MQ=255)
acacCTTTTGAACCGAGAGTACGGATCTCAATAACATCTTGACCACGCGTGCCTTTCAGGATATCCAGTTCAACTGCTGTCTCCGCGTTGAGGGCGGGTTCTGCTTTCGTATCAGCCTTCTAAGGTCTCCGTCGCGCCtactt > 2:387070/1‑139 (MQ=255)
gcttttgGAACTGTGAGTGCTGATATCAATAACAGCTTGGCCCAGCGTGCCTTTCAGCACATCCAGGTCAACAGCTGTATCCCCGTTGAGGGTGGGTTGTGCTTGTGTATCAGCCATTTAAGGTCTCCTTAGCGCCTTATTGc < 2:902158/140‑1 (MQ=255)
acCTTTTGAACCGAGAGTACGGATATCAATAACATCTTGACCCAGCGTGCCTTTCAGCACATCCAGTTCAACAGCTGTATCCCCGTTGAGGGTGGGTTTTGCTTTTGTATCAGCCATTTAAGGTCTCCTTAGCGCCTTATTGc > 1:543650/1‑143 (MQ=255)
ttttGAACCGAGAGTACGGATATCAATAACATCTTGACCCAGCGTGCCTTTCAGCACATCCAGTTCAACAGCTGTATCCCCGTTGAGGGTGGGTTTTGCTTTTGTATCAGCCATTTCAGGTCTCCTTAGCGCCTTATTGCGTa > 1:1104005/1‑143 (MQ=255)
tttGAACCGAGAGTACGGATATCAATAACATCTTGACCCAGCGTGCCTTTCAGCACATCCAGTTCAACAGCTGTATCCCCGTTGAGGGTGGGTTTTGCTTTTGTATCAGCCATTTAAGGTCTCCTTAGCGCCTTATTGCGTaa < 1:660576/143‑1 (MQ=255)
tttGAACCGAGAGTACGGATATCAATAACATCTTGACCCAGCGTGCCTTTCAGCACATCCAGTTCAACAGCTGTATCCCCGTTGAGGGTGGGTTTTGCTTTTGTATCAGCCATTTAAGGTCTCCTTAGCGCCTTATTGCGTaa < 2:169532/143‑1 (MQ=255)
tGAACCGAGAGTACGGATATCAATAACATCTTGGCCCAGCGTGCCTTTCAGAACATCCAGTTCATCAGCTGTATCCCCGTTGAGGGTGGGTTTTGCTTTTGTATCAGCCATTTAAGGTCTCCTTAGCGCCTTATTGCGTAAGa < 2:511991/143‑1 (MQ=255)
aCCGAGAGTACGGATATCAATAACATCTTGACCCAGAGTGCCTTTCAGCACATCCAGTTCAACAGCTGTATCCCCGTTGAGGGTGGGTTTTGCTTTTGTCTCAGCCATTTAAGGTCTCCTTAGCGCCTTATTGCGTAAGCCTg > 1:781192/1‑143 (MQ=255)
cGAGAGTACGGATATCAATAACATCTTGACCCAGCGTGCCTTTCAGCACATCCAGTTCAACAGCTGTATCGCCGTGGAGGGTGGGTTTTGCTTTTGTATCACCCATTTAAGGTCTCCTTAGCGCCTGATTGCGTAAGACTGcc > 2:652035/1‑143 (MQ=255)
cgTACGGATATCAATAACATCGTGACCCAGCGTGCCTTTCAGCACATCCAGTTCAACAGCTGTATCCCCGTTGAGGGTGGGTTTTGCTTTTGTATCAGCCATTTAAGGTCTCCTTAGCGCCTTATTGCGTAAGACTGCCGGaa < 2:836253/142‑1 (MQ=255)
agTACGGATATCAATAACATCTTGACCCAGCGTGCCTTTCAGCCCATCCCGTACAACAGCTGTATCCCCGTTGAGGGTGGGTTTTGCTTTTGTATCAGCCATTTAAGGTCTCCTTAGCGCCTTATTGCGTAAGACTGCCGGaa < 1:108087/143‑1 (MQ=255)
ggATATCAATAACATCTTGACCCAGCGTGCCTTTCAGCACATCCAGTTCAACAGCTGTATCCCCGTCGAGGGTGGGTTTTGCTTTTGTATCAGCCATTTAAGGTCTCCTTAGCGCCTTATTGCGTAAGCCTGCCGGAACTTaa > 2:1225229/1‑143 (MQ=255)
atatCAATAACATCTTGACCCAGCGTGCCTTTCAGCACATCCAGTTCAACAGCTGTATCCCCGTTGAGGGTGGATTATGCATTTGTATCAGCCATTTAAGGTCTCCTTAGCGCCTTATTGCGTAAGACTGCCGGAACTTAAAt > 2:433776/1‑143 (MQ=255)
atCAATAACATCTTGACCCAGCGTGCCTTTCAGCACATCCAGTTCAACAGCTGTATCCCCGTTGAGGGTGGGTTTTGCTTTTGTATCAGCCATTTAAGGTCTCCTTAGCGCCTTATTGCGTAAGACTGCCGGAACTTAAAttt < 2:447676/143‑1 (MQ=255)
cAATAACATCTTGACCCAGCGTGCCTTTCGGCTCTGCCACCCCAACAGCTGTATCCCCGTTGAGGGTGGGTTTTGCTTTTGTATCAGCCATTTAAGGTCTCCTTAGCGCCTTATTGCGTAAGACTGCCGGAACTTAAATTTGc < 2:543650/143‑1 (MQ=255)
cAATAACATCTTGACCCAGCGTGCCTTTCAGCACATCCAGTTCAACAGCTGTATCCCCGTTGAGGGTGGGTTTTTCTTTTGTATCAGCCATTTAAGGTCTCCTTAGCGCCTTATTGCGTAAGACTGCCGGAACTTAAATTTGc < 1:422329/143‑1 (MQ=255)
aTAACATCTTGACCCAGCGTGCCTTTCAGCACATCCAGTTCAACAGCTGTATCCGCGGTGAGGGTGGGTGTTGCTTTTGTATCAGCCATTTAAGGTCTCCTTCGCGCCTTGTTTCGTAAGACTTACGGAACTTCACtttttct > 2:854904/1‑139 (MQ=255)
aaCATCTTGACCCAGCGTGCCTTTCAGCACATCCAGTTCAACAGCTGTATCCCCGTTGAGGGTGGGTTTTGCTTATGTATCAGCCTTTTAAGGTCTCCTTAGCGCCTTATTGCGTAAGACTGCCGGAACTTAAATTTGCCTTc < 1:465698/143‑1 (MQ=255)
aCATCTTGACCCAGCGTGCCTTTCAGCACATCCAGTTCAACAGCTGTATCCCCGTTGAGGGTGGGTTTTGCTTTTGTATCAGCCCTTTAAGGTCTCCTTAGCGCCTTATTGCGTAAGACTGCCGGAACTTAAAGCTGCCTTCg > 2:93391/1‑143 (MQ=255)
aCATCCTGACCCAGCGTCCCTTTCAGCACATCCAGTTCAACAGCTGTATCCCCGTTGAGGGTGGGTTTTGCTTTTGTATCAGCCATTTAAGGTCTCCTTAGCGCCTTATTGCGTAAGACTGCCGGAACTTAAATTTGCCTTCg < 1:918384/143‑1 (MQ=255)
cATCTTGACCCAGCGTGCCTTTCAGCACATCCAGTTCAACAGCTGTATCCCCGTTGAGGGTGGGTTTTGCCTTTGTATCAGCCCTTTAAGGTCTCCTTCGCGCCTTCTTGCGTAAGGCTGCCGGACCTTAACTTTGCCTTCGc > 1:302844/1‑143 (MQ=255)
tGATCCAGCGTGCCTTTCAGCACATCCAGTTCAACAGCTGTATCCCCGTTGAGGGTGGGTTTTGCTTTTGTATCAGCCATTTAAGGTCTCCTTAGCGCCTTATTGCGTAAGACTGCCGGAACTTAAATTTGCCTTCGCACATc < 2:346986/143‑1 (MQ=255)
cccAGCGTGCCTTTCAGCACATCCAGTTCAACAGCTGTATCCCCGTTGAGGGTGGGTTTTGCTTTTGTATCAGCCATTTAAGGTCTCCTTAGCGCCTTATTGCGTAAGACTGCCGGAACTTAAATTTGCCTTCGCACATCAAc > 1:652943/1‑143 (MQ=255)
cAGCGTGCCTTTCAGCACATCCAGTTCAACAGCTGTATCCCCGTTGAGGGTGGGTTTTGCTTTTGTATCAGCCATTTAAGGTCTCCTTAGCGCCTTATTGCGTAAGACTGCCGGAACTTAAATTTGCCTTCGCACATCAACCt > 1:149894/1‑143 (MQ=255)
cAGCGTGCCTTTCAGCACATCCAGTTCAACAGCTGTATCCCCGTTGAGGGTGGGTTTTGCTTTTGTATCAGCCATTTAAGGTCTCCTTAGCGCCTTATTGCGTAAGACTGCCGGAACTTAAAGTTGCCTTCGCACATCAACCt > 1:835008/1‑143 (MQ=255)
cAGCGTGCCTTTCAGCACATCCAGTTCAACAGCGGGAGCCCCGTTGAGCGTGCGTTGTGCGACTGTACCAACCATTCAGGGTCTCCTTAGCGCCTTATTGCGTACGACTGCCGGGACTTGAATTTGCGTTCGCACATCAACCt > 2:261793/1‑143 (MQ=255)
ccTTTCAGCACATCCAGTTCAACAGCTGTATCCCCGTTGAGGGTGGGTTTTGCTTTTGTATCGGCCATTTAAGGTCTCCTTAGCGCCTTATTGCGTAAGACTGCCGGAACTTAAATTTGCCCTCGCACATCAACCTGGCTTTa > 2:1086491/1‑143 (MQ=255)
ccTTTCAGCACATCCAGTTCAACAGCTGTATCCCCGTTGAGGGTGGGTTTTGCTTTTGTATCAGCCATTTAAGGTCTCCTTAGCGCCTTATTGCGTAAGACTGCAGGATCTTGAAGGTGACTTCGCACATCAACCTGGCTTTa < 2:1212130/143‑1 (MQ=255)
cTTTCAGCACATCCAGTTCAACAGCTGTATCCCCGTTGAGGGTGGGTTTTGCTTTTGTATCAGCCATTTAAGGTCTCCTTAGCGCCTTATTGCGTTAGACTCCCGGAACTTAAATTTACCTTCGCACATCAACCTGGCATTaa > 1:105099/1‑142 (MQ=255)
cTTTCAGCACATCCAGTTCAACAGCTGTATCCCCGTTGAGGGTGGGTTTTGCTTTTGTATCAGCCATTTAAGGTCTCCTTAGCGCCTTATTGCGTAAGACTGCCGGAACTTAAATTTGCCTTCTCTCATCAACCTGGCTTTAc < 2:754474/143‑1 (MQ=255)
tttCAGCACATCCAGTTCAACAGCTGTATCCCCGTTGAGGGTGGGTTTTGCTTTTGTATCAGCCATTTAAGGTCTCCTTAGCGCCGTATTGCGTAAGTCTGCCGGAACTTAAATTTGCCTTCGCACATCAACCTGGCTTTAcc > 2:332791/1‑143 (MQ=255)
gCACATCCAGTTCAACAGCTGTATCCCCGTTGAGGGTGGGTTTTGCTTTTGTATCAGCCATTTAAGGTCTCCTTAGCGCCTTATTGCGTAAGACTGCCGGAACTTAAATTTGCCTTCGCACATCAACCTGGCTTTACCCGttt < 1:215421/143‑1 (MQ=255)
cacaTCCAGTTCAACAGCTGTATCCCCGTTGAGGGTGGGTTTTGCTTTTGTATCAGCCATTTAAGGTCTCCTTAGCGCCTTATTGCGTAAGACTGCCGGAACTTAAATTTGCCTTCGCACATCAACCTGGCTTTACCCGtttt > 1:841662/1‑143 (MQ=255)
tCCAGTTCAACAGCTGTATCCCCGTTGAGGGTGGGTTTTGCTTTTGTATCAGCCATTTAAGGTCTCCTTAGCGCCTTATTGCGTAAGACTGCCGGAACTTAAATTTGCCTTCGCACATCAACCTGGCTTTACCCGTTTTTTAt > 1:687649/1‑143 (MQ=255)
ccAGTTCAACAGCTGTATCCCCGTTGAGGGTGGGTTTTGCTTTTGTATCAGCCATTTAAGGTCTCCTTAGCGCCTTATTGCGTAAGACTGCCGGAACTTAAATTTGCCTTCGCACATCAACCTGGCTTTACCCGTTTTTTAtt > 2:46888/1‑143 (MQ=255)
cAGTTCCACAGCTGTATCCCCGTTGAGGGTTGGTTTTGCTTTTGTATCAGCCATTTAAGGTCTCCTTAGCGCCTTATTGCGTAAGACTGCCGGAACTTAAATTTGCCTTCGCACATCAACCTGGCTTTACCCGTTTTTTAttt < 2:1112618/143‑1 (MQ=255)
cAGTTCAACAGCTGTATCCCCGTTGAGGGTGGGTTTTGCTTTTGTATCAGCCATTTAAGGTCTCCTTAGCGCCTTATTGCGTAGGACTGCCGGCACTTAAATTTGCCTTCGCAAATTAACCTCGCATTACCCGTTTTTTGttt > 2:539687/1‑143 (MQ=255)
cAGTTCAACAGCTGTACCCCCGTTGAGGGTGGGTTTTGATAATATTTCAGCCATTTAAGGTCTCCTTAGCGCCTTATTGCGTAAGACTGCCGGAACTTAAATTTGCCTTCGCACATCAACCTGGCTTTACCCGTTTTTTAttt < 1:697129/143‑1 (MQ=255)
aGTTCAACAGCTGTATCCCCGTTGAGGGTGGGTTTTGCTTTTGTATCAGCCATTTAAGGTCTCCTTAACGCCTTATTGCGTAAGACTGCCGGAACTTAAATTTGCCTTCGCACATCAACCTGGGTTTACCGGAGTTTTATTTg > 1:438004/1‑143 (MQ=255)
gtctaaCAGCTGTATCTCCTTTGAGGGTGGGTTGTGCTTTTGTATCAGCCATTTAAGGTCTCCTTAGCGCCTTATTGCGTAAGACTGCCGGAACTTAAATTTGCCTTCGCACATCAACCTGGCTTTACCCGTTTTTTATTTgg < 2:541423/139‑1 (MQ=255)
aGCTGTATCCCCGTTGAGGGTGGGTTTTGCTTTTGTATCAGCCATTTAAGGTCTCCTTAGCGCCTTATTGCGTAAGACTGCCGGAACTTAAATTTGCCTTCGCACATCAACCTGGCTTTACCCGTTTTTTATTTGGCTcgccg > 1:812638/1‑143 (MQ=255)
ccGTTGAGGGTGGGTTTTGCTTTTGTATCAGCCATTTAAGGTCTCCTTAGCGCCTTATTGCGTAAGACTGCCGGAACTTAAATTTGCCTTCGCACATCAACCCGGCTTTACCCGTTTTTTATTTGGCTCGCCGCTCTGTGaaa < 2:1104005/143‑1 (MQ=255)
tGAGGGTGGGTTGGGCTTTTGTATCAGCCCTTTAAGGTCTCCTTAGCGCCTTATTGCGTAAGACTGCCGGAACTTAAATTTGCCTTCGCACATCGACCTGGCTTTGCGCGTTTTTTATTTGACTCGCCGCTCTGTGAAAGAgg < 2:60164/143‑1 (MQ=255)
gggtgggtTTTGCTTTTGTATCAGCCATTTAAGGTCTCCTTAGCGCCTTATTGCGTAAGACTGCCGGAACTTAAATTTGCCTTCGCACATCAACCTGGCTTTACCCGTTTTTTATTTGGCTCGCCGCTCTGTGAAAGAGGGGa > 2:132834/1‑143 (MQ=255)
|
GCAGGATGCGGTTGAAGTGAAGCCTGGGTCAAAGGTGAACACACCTTTTGAACCGAGAGTACGGATATCAATAACATCTTGACCCAGCGTGCCTTTCAGCACATCCAGTTCAACAGCTGTATCCCCGTTGAGGGTGAGTTTTGCTTTTGTATCAGCCATTTAAGGTCTCCTTAGCGCCTTATTGCGTAAGACTGCCGGAACTTAAATTTGCCTTCGCACATCAACCTGGCTTTACCCGTTTTTTATTTGGCTCGCCGCTCTGTGAAAGAGGGGA > NC_000913/754310‑754583
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
