Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A8 F12 I0 R1
|
158 |
5737.7 |
7407908 |
98.3% |
7281973 |
135.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP022686 |
3,935,324 |
T→G |
15.7% |
N705T (AAC→ACC) |
lacZ ← |
beta‑galactosidase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP022686 | 3,935,324 | 0 | T | G | 15.7%
| 239.5
/ 15.8
| 146 | N705T (AAC→ACC) | lacZ | beta‑galactosidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (28/92); new base G (20/6); total (48/98) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.42e-07 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 161 total aligned reads displayed.
CTCGATGCAAAAATCCGTTCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGCCAACATCCAGAGGCACTTCACCGCTTGCCAGCGGCTTGCCATCCAG > NZ_CP022686/3935185‑3935463
|
cTCGATGCAAAAATCCGTTCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑Gt > 6:123631/1‑140 (MQ=255)
cTCGATGCAAAAATCCGTTCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑Gt > 3:571819/1‑140 (MQ=255)
cTCGATGCAAAAATCCGTTCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑Gt > 2:522897/1‑140 (MQ=255)
aTGCAAAAATCCGTTCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑Gttt < 7:565593/138‑1 (MQ=255)
aTGCAAAAATCCGTTCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTgg < 2:573628/140‑1 (MQ=255)
tGCAAAAATCCGTTCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGCCGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GGTTggg > 5:687331/1‑139 (MQ=255)
tGCAAAAATCCGTTCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGGTTTgg > 1:197517/1‑140 (MQ=255)
tGCAAAAATCCGTTCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTg < 8:174204/138‑1 (MQ=255)
tGCAAAAATCCGTTCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGGt > 2:290687/1‑140 (MQ=255)
tGCAAAAATCCGTTCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GGTTGGt > 1:288718/1‑140 (MQ=255)
tGCAAAAATCCGTTCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCGGAGGTTTTCCTCCAGACTCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTggg > 5:230078/1‑139 (MQ=255)
tGCAAAAATCCGATCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCTCAAGACGCCATTTCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GGTTGGt > 5:752239/1‑140 (MQ=255)
cAAAAATCCGTTCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GGTTGGt > 7:565577/1‑138 (MQ=255)
cAAAAATCCGTTCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGAGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTggg > 8:567447/1‑137 (MQ=255)
aaaaaTCCGTTCCGCTGGTGGTCAGGTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGGTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGGtt < 7:125766/138‑1 (MQ=255)
aaaaaTCCGGTCCTCTGGTGGTACGTTGAGTGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGGCACGATGAGGTTTTACTCAAGACGCCATTTCAGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGGTTGc < 3:809263/140‑1 (MQ=255)
aaaTCCGTTACGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGGTTGCAc < 3:533727/140‑1 (MQ=255)
aaaTCCGTGCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGGGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGGTTGCAc < 2:108055/140‑1 (MQ=255)
aTCAGTTCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGGTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GGTTGGTTGCACTa < 5:392300/140‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGGGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGGTTGCACTAcgcg < 6:889532/140‑1 (MQ=255)
gCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGGTTGCACTACGCGTAc < 7:183267/138‑1 (MQ=255)
gCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGGCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGTCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTAGGTTGCACTACGCGTACCg < 3:679980/140‑1 (MQ=255)
cTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGGTTGCACTACGCGTACCGt < 3:928295/140‑1 (MQ=255)
gtggtCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGGTTGCACTACGCGTACCGtt < 7:452589/138‑1 (MQ=255)
tggtCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGc < 1:522897/140‑1 (MQ=255)
gggtCAGTTGAGGGAGGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGc < 5:285250/139‑1 (MQ=255)
tCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACTCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTATGACCATGCGGTCGC‑GTGTGGTTGGGCTACGCGGACCGGTAGCCag > 4:674535/1‑140 (MQ=255)
cAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGAGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCTGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCaga < 5:33775/140‑1 (MQ=255)
gAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTa < 8:123343/129‑1 (MQ=255)
gATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGGTTGCACTACGCGTTCCGGTAGCCCGAGGTGTCCgg > 2:513916/1‑140 (MQ=255)
gATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTcc < 7:94847/138‑1 (MQ=255)
tGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCgg < 7:638299/138‑1 (MQ=255)
tGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGgcg < 2:861331/140‑1 (MQ=255)
tGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGgcg < 2:784297/140‑1 (MQ=255)
ggCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGGTTGCACTACGCGGACCGGTAGCCAGAGTTGTCCGgcgg > 3:453889/1‑139 (MQ=255)
gCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGCGGTATTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGCCCATGCGGTCGC‑GGTAGGGTTACCAACGCGGACCGGTAACCACAGTTGTCcgccgcc > 6:36549/1‑139 (MQ=255)
gCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCgggg > 8:561715/1‑136 (MQ=255)
gCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GGTTGGTTTCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGgcgcg > 3:218313/1‑139 (MQ=255)
gCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GGTTGGTTGCCCTACCCGTACCGTTAGCCACAGTTGTCCGgcgcg > 4:433311/1‑139 (MQ=255)
gCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACAATGCGGTCGC‑GTTTGGTTGGACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGgcgcg > 3:492335/1‑139 (MQ=255)
gCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGAGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGGTTGCACTACCCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGgcg > 8:561719/1‑138 (MQ=255)
gCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTAACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCTCTGATGTGTCAGGCTTCTGACCATGCGGACGC‑GTTTGGTTTCACAACGCCTACCCTTAGCCAGATTTTTGCggaacg > 3:216231/1‑136 (MQ=255)
gCGTGGGACGCGCACGGGAGAGTCACGCTGACGTTTTCCTCCAGACGCCATTGATGCCAGTCGCTGAAGTGACCTGCTACTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGGGTGTACAAAGCGAACCATTATCAACACTTGTcccgggcg > 2:97411/1‑134 (MQ=255)
gggggACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGGTTGCACTACGCGGACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGct < 8:794219/136‑1 (MQ=255)
gTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCTGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGctct < 5:129186/140‑1 (MQ=255)
gTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTGTGGTTTGACTACGCGGACCGATAGGCCGAGGTGTCCGgcgcg > 7:255076/1‑137 (MQ=255)
gACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GGTTTGTTGCACAACGCCGACCGTTACCCAGCGTTTGCCGCCGCTCTGCgg > 6:184710/1‑140 (MQ=255)
aCGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTGGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGc < 4:457252/140‑1 (MQ=255)
gcgGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTg < 5:790130/140‑1 (MQ=255)
ggAGGGGATTGTCACGCTGAGGTTGTCCGCCCTACGCCATTTCTGCCAGGCTCTGACTGGTCCGGCTTCGGACCATGCTGGGGC‑GTTTGGTTTCACAACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCg < 4:250558/140‑1 (MQ=255)
ggAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTg < 8:679374/138‑1 (MQ=255)
ggAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCg < 3:921019/140‑1 (MQ=255)
ggAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTGTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTg < 7:91665/138‑1 (MQ=255)
aGGGGAGGGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCggc < 6:713479/140‑1 (MQ=255)
ggAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCGAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCggcagt < 1:111486/140‑1 (MQ=255)
ggAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCggca < 7:87143/138‑1 (MQ=255)
tgtCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGGTTGCACTACGCCTAACGTTAGCCAGAGTTATACCGCGCTATCCCGCAGCggccgttcaa > 6:315834/1‑139 (MQ=255)
tgtCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GGTTGGTTTCCCAACGCGTACCCGTTGCCAGAGTTGTACGGCCCGCACCCGCGGCggcagataaa > 6:18885/1‑135 (MQ=255)
gtCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGGTTGCTCTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCggcagttcagg < 5:764879/140‑1 (MQ=255)
gtCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCggcagttcagg < 3:882191/140‑1 (MQ=255)
gtCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCggcagttca < 8:2949/138‑1 (MQ=255)
gtCACGCTGAGGTTTGCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCggcagttca < 8:447821/138‑1 (MQ=255)
cACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGAggcagttcaggca < 6:392141/140‑1 (MQ=255)
cACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GGTTTGTTGCACTACGCGTACCGTTATCCAGAGTTTTACGGCGCGCGCCGGCTGCggcaggtcatgcc > 1:635326/1‑139 (MQ=255)
gCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCggcagttcaggcagtt < 1:107259/140‑1 (MQ=255)
taGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCAAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGGTTGCACTACGCGAACCGGTAGCCAGAGTTGGCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCA‑GCATTtcaat < 5:587452/139‑1 (MQ=255)
aGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTtcaat < 3:925126/140‑1 (MQ=255)
aGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTtcaat < 3:709997/140‑1 (MQ=255)
aGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCACAGTTGTCCGGCGCTCGCCGGCGGCGGCAGGTCAGGCAGTtcaaa > 4:729278/1‑139 (MQ=255)
ggTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTtcaatc < 1:384912/140‑1 (MQ=255)
tttCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGGTTGCTCTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAAc < 5:263731/140‑1 (MQ=255)
ttCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GGTTGGTTGGACTACGCGGACCGTTAGCCAGAGGTGTCCGGCGCGCTCCGGCGGCGGGCGTTAAGGCAGTtaaataaaat > 3:785480/1‑138 (MQ=255)
tCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTg < 4:571819/140‑1 (MQ=255)
cGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTGCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTg < 7:441523/138‑1 (MQ=255)
cGCCATTGCTGCCATGCGCTGATGGGTCCGGCTTCTGCCCATGCGGGCGC‑GTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCTGTTCAATCAACTGCTTACCTTg < 5:726646/140‑1 (MQ=255)
cATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GGTTGGTTGCCAGACGCGTAACCTTAGCCAGCCTTGTCCGGCGCGCACCGGCAGCGGCCGTTAAGGGCGTGAAATACAATGCTTAGCATGCgg > 4:78126/1‑140 (MQ=255)
tgctgcCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCggg < 8:227826/138‑1 (MQ=255)
tgctgcCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGcc < 1:430783/140‑1 (MQ=255)
gctgcCAGTCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCTGTCGC‑GTTTGGTTGCACTACGCGGACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGc < 7:64592/138‑1 (MQ=255)
gctgcCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGTTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGTCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGc < 7:612042/138‑1 (MQ=255)
gctgcCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGc < 8:238167/138‑1 (MQ=255)
ctgcCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GGTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGcc < 8:111910/138‑1 (MQ=255)
gcCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGGTTGCACTACTCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTGCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGCCAACa < 5:4484/140‑1 (MQ=255)
gcCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGCCAACa < 1:493458/140‑1 (MQ=255)
aGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCGCTCCGGCGGCGGCAGTTCAGGCAGTTAAATCAACTGCTTACCTTGGGGGGCAACATcc > 2:493458/1‑140 (MQ=255)
aGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GGTTGGTTGCACTACGCGGACCGTTATCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGCCAACATcc > 4:477207/1‑140 (MQ=255)
cTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGCCAACATCCAGAgg < 3:786661/140‑1 (MQ=255)
tCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCGCACCGGCTGCGGGAAGTCAGGCAGTTAAATAAAAAGCTTAACCTTCGGGCCAACAAACCGAGGCAcataac > 2:460277/1‑135 (MQ=255)
cGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGGTTGCCCTAACCGGACCGTTATACAGAGTTTTACCGCGCGCTACGGCTGCGGCATTTAAAGCAGTTGAATCAACTGCTTAACATGCGGGCCACCATCCCGAGGCAcataac > 8:350794/1‑133 (MQ=255)
cGGCGTCTGACCATGCGGGCGC‑GTTTGGTTGCACTACGCGGACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGCCAACATCCAGAGGCACTTCACCg < 3:748777/140‑1 (MQ=255)
ggCGTCTGCCCATGCGGTCGC‑GTTTGGTTGCACTACGCGTACCGGTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGCCAACATCCAGAGGCACTTCACCGc < 6:530203/140‑1 (MQ=255)
aTGCGGTCGC‑GTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGCCAACATCCAGAGGCACTTCACCGCTTGCCAGCGGc < 5:522094/140‑1 (MQ=255)
aTGCGGTCGC‑GTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGCCAACATCCAGAGGCACTTCACCGCTTGCCAGCGGc < 1:341065/140‑1 (MQ=255)
cGGTCGC‑GTTTGGTTGCACTACGCGTTCCGTTAGCCAGAGTTGTACGGCGCGCTACGGCGGGGGCAGTTAAGGGACGTGAATCACCAGGTTACCTTGCGGGCCCACATCCACCGGACCATCACCCCTTGCCcgccgcg > 8:614663/1‑137 (MQ=255)
cGGTCGC‑GTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGCCAACATCCAGAGGCACTTCACCGCTTGCCAGCGGCTTg < 6:101848/140‑1 (MQ=255)
cGGTCGC‑GGTTGGTTGCACTACGCGGACCGTTTGCCAGAGTTGTCCGGCGCGGTCCGGCTGCGGCCGGTCAGGGCGTTCAATCAACTGGGTACCTTGAGGGCCCACATCCAGCGGCACTTCACCCCTTTCCCGCGGcg > 8:102923/1‑137 (MQ=255)
gTCGC‑GGTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGCCAACATCCAGAGGCACTTCACCGCTTGCCAGCGGCTTg < 8:189381/138‑1 (MQ=255)
tttGGTTTCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCATGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGCCAACATCCAGAGGCACTTCACCGCTTGCCAGCGGCTTGCCATCCAg < 3:285103/140‑1 (MQ=255)
tttGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGCCAACATCCAGAGGCACTTCACCGCTTGCCAGCGGCTTGCCATcc < 7:114237/138‑1 (MQ=255)
tttGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGCCAACATCCAGAGGCACTTCACCGCTTGCCAGCGGCTTGCCATCCAg < 6:64037/140‑1 (MQ=255)
|
CTCGATGCAAAAATCCGTTCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGC‑GTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGCCAACATCCAGAGGCACTTCACCGCTTGCCAGCGGCTTGCCATCCAG > NZ_CP022686/3935185‑3935463
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
