Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A10 F2 I0 R1
|
233 |
6461.8 |
9239822 |
98.3% |
9082745 |
135.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP022686 |
3,935,324 |
T→G |
8.8% |
N705T (AAC→ACC) |
lacZ ← |
beta‑galactosidase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP022686 | 3,935,324 | 0 | T | G | 8.8%
| 374.0
/ 11.3
| 194 | N705T (AAC→ACC) | lacZ | beta‑galactosidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (39/135); new base G (18/2); total (57/137) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.50e-09 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 207 total aligned reads displayed.
CTCGATGCAAAAATCCGTTCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGCCAACATCCAGAGGCACTTCACCGCTTGCCAGCGGCTTGCCATCCAG > NZ_CP022686/3935185‑3935463
|
cTCGATGCAAAAATCCGTTCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGCTGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGt > 8:686141/1‑140 (MQ=255)
gATGCAAAAATCCGTTCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCTTTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTAGCGTT‑Tg > 8:857722/1‑140 (MQ=255)
gATGCAAAAATCCGTTCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGat‑tt > 2:173021/1‑139 (MQ=255)
gATGCAAAAATCCGTTCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑Tg > 2:434384/1‑140 (MQ=255)
gATGCAAAAAACCGTTCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGGT‑Tg > 3:199582/1‑140 (MQ=255)
aTGCAAAAATCCGTTCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑Tgg < 4:577337/140‑1 (MQ=255)
aTGCAAAAATCCGTTCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGAGGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑Tgg < 4:510093/140‑1 (MQ=255)
tGCAAAAATCCGTTCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑Tggg > 3:488822/1‑139 (MQ=255)
tGCAAAAATCCGTTCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑Tg < 6:871113/138‑1 (MQ=255)
tGCAAAAATCCGTTCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGt > 1:352205/1‑140 (MQ=255)
cAAAAATCCGTTCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATTCGGTCGCGTT‑TGGt > 5:926159/1‑138 (MQ=255)
aaaaaTCCGTTCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGc < 4:463780/140‑1 (MQ=255)
aaacTCCGTTCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCa < 8:878681/140‑1 (MQ=255)
aaaaTCCGTTCCGCAGGTGGTCAGTTGAGGGATTGCGTGTGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCGGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCa < 3:321790/140‑1 (MQ=255)
aaaTCCGTTCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCAc < 4:1147997/140‑1 (MQ=255)
aaaTCCGTTCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGGCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGc < 6:669788/138‑1 (MQ=255)
aaaTCCGTTCCGCGGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGGGGGACGCGGAGGGGAGGGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGc < 6:222145/138‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGTCTGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCACTAcgcg < 3:1086878/140‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCACTAcgcg < 7:983434/140‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCACTAcgcg < 8:752674/140‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGGGGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCACTAcgcg < 7:322479/140‑1 (MQ=255)
ttCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGCCGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGCCCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCCCTAcgcgg > 4:831763/1‑139 (MQ=255)
ttCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGGT‑TGGTTTGACTTcgccg > 1:986413/1‑138 (MQ=255)
ttCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGACACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCACTAcgc > 5:279603/1‑138 (MQ=255)
tCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGGTGCTCTAcgcg > 6:479679/1‑138 (MQ=255)
gCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGATGTGAGTGTCACGATGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCACTACGCGTACCg < 2:136538/140‑1 (MQ=255)
gCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCACTACGCGTACCg < 1:783009/140‑1 (MQ=255)
gCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCACTACGCGTACCg < 3:192305/140‑1 (MQ=255)
gCTGGTGGGCAGGTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGCGTGGCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGGGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCACTACGCGTACCg < 8:768232/140‑1 (MQ=255)
gCTGGGGGGCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGTGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCACTACTCGTACCg < 1:838411/140‑1 (MQ=255)
ggggtcgTTGATGGATGGCGTGGGTAGCGGAGGGGCGTGTAACGCGGATGGTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGGGTCCGTCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCACTACGCGTACCGTTa < 6:799674/132‑1 (MQ=255)
ggtCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCACAACGCGTACCGTTat > 5:1111629/1‑137 (MQ=255)
gAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCCCTACGCGTACCGTTAGCCAGAGtt > 5:556180/1‑138 (MQ=255)
aGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCCCGACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGtg > 2:32084/1‑139 (MQ=255)
gATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGATGTTTTACGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑GGGTTGCACTACGCGTAACGTTAGCCAGAGTTGTCCgg < 7:229336/140‑1 (MQ=255)
gATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCgg < 2:94827/140‑1 (MQ=255)
gATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGCTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCgg < 1:1009370/140‑1 (MQ=255)
tGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGATGTTTTCAGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGgcg < 3:15201/140‑1 (MQ=255)
gCGTGGGACGCGGAGGGGATTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCTTTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCAAGCTGTCGCGTTGTGGTT‑CACATCGCGAAAAGTTAGCCAGAGTTTTgcggcggg > 8:501865/1‑138 (MQ=255)
gCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TTGTTGCACTACGCGTAACGTTATCCAAAGTTGTCCGgcgcg > 7:450876/1‑139 (MQ=255)
gCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCACTACGCGGACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGgcc > 6:1020395/1‑137 (MQ=255)
gCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGGT‑TGGTTGCACTAACCGTACCGTTAGCCCGACTTGTCCCgcccc > 7:435154/1‑137 (MQ=255)
gCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGGT‑TGGGTGCACTACGCGTACCCGTTGCCAGAGTTGTCCGgcgcc > 1:373153/1‑139 (MQ=255)
gCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGGG‑TGGTTGCACTACGCGGACCGTTAGCCAGAGTATTACGgcg > 6:1127106/1‑138 (MQ=255)
gTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCACTACGCGGACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGgcgca > 6:25666/1‑137 (MQ=255)
gTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCACGACGCGTACCGTTTGCCAGAGTTGTACGgcccg > 6:508631/1‑135 (MQ=255)
gTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGGT‑TGGTTGGACTACGCGTACCGTTCGCCAGAGTTGTGCCgcgcc > 5:214724/1‑137 (MQ=255)
ccgcgGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGc < 1:479377/139‑1 (MQ=255)
ccgcgGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGGTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTG‑TGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCgtc < 2:473862/139‑3 (MQ=255)
ggAGGTGAGGGTCACGCTGAGGTGTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCg < 2:868838/140‑1 (MQ=255)
ggAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCCGAGGTGTACGGCGCGCGCCGgcggcg > 4:1041140/1‑140 (MQ=255)
ggAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTg < 5:902888/138‑1 (MQ=255)
ggAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCg < 2:762790/140‑1 (MQ=255)
ggAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGGCCGGCTGCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCg < 4:983310/140‑1 (MQ=255)
ggAGGGGAGTGTCACGCTGAGGGTTTCCGCCAGACGCCTTTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCg < 8:264649/140‑1 (MQ=255)
gAGGGGAGTGTCACTCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGc < 5:832949/138‑1 (MQ=255)
tgtCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTGGCACTACGCGTACCGGTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCggcagttccg > 8:409923/1‑138 (MQ=255)
tgtCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGGG‑TGGGTGGACAAAGCGGACCGGTATCCAGCGGTTTCAGGCGCGCTCCGGCTGCggccgttg > 5:326720/1‑137 (MQ=255)
tgtCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAAGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGGT‑TTGTTGCCCTACGCCTGACGGTAGCCACCGGTGTGAGGCGCGTAGCGGCTGCggcaggtcgg > 1:829221/1‑138 (MQ=255)
tgtCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGATGCCCGGCGCTGATGTGTCCGGCTACTGACCATGCGGTCGCGGT‑TTGTTGGGCGAAGCGTCCCGTTTGCCATAGTTTTCCGGCCCTCTCAGGCTGCcgcgcttcag > 8:124554/1‑140 (MQ=255)
gtCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCggcagttcagg < 2:501446/140‑1 (MQ=255)
gtCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCggcagttcagg < 3:1151802/140‑1 (MQ=255)
gtCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCggcagttcagg < 7:558334/140‑1 (MQ=255)
gtCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCggcagttcagg < 3:37377/140‑1 (MQ=255)
ggcACGCTGCGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGGTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCggcagttcagg < 8:888146/138‑1 (MQ=255)
tCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGGT‑TGGTTTCACTACGCGTACCGTTAGCCACAGTTGTCCGGCGCGATCCCGCAGCggcaggtgag > 6:412877/1‑133 (MQ=255)
cACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCggcagttcaggca < 8:200082/140‑1 (MQ=255)
gCTGAGGTTTTGCGCCAGACGCCATTGCTGGGAGGAGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGGGTT‑TGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGACAGTGTTGTCCGGCTCTCTCCGGCTGCggcagttcaggctgtt < 7:898478/140‑1 (MQ=255)
aGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTtcaat < 3:1041140/140‑1 (MQ=255)
aGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCACTACGCGTAACGTTAGCCACAGTTGTCCGGCGCTCACCGGCGGCGGCAGTTCAGGCACTtaaaa > 2:1182730/1‑139 (MQ=255)
aGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCGTCTGACCATGGGGTCGCGTT‑TGGTTGCACTACGCGTACAGTTATCCAGAGTTGTCCGGAGCGCGGCCGCTGGgggagttaatggagttgatg > 1:973398/1‑136 (MQ=255)
aGGTGTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGGTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTtcaat < 2:717607/140‑1 (MQ=255)
ggTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTtcaatc < 7:173382/140‑1 (MQ=255)
ttttCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCACTACGCGTTCCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTtcaatcaa < 3:249425/140‑1 (MQ=255)
cGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCGTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCGCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTg < 6:895526/138‑1 (MQ=255)
ccATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCg < 3:169366/140‑1 (MQ=255)
ccATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCg < 4:393121/140‑1 (MQ=255)
tgctgcCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGcc < 1:935314/140‑1 (MQ=255)
gctgcCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGTCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGCCa < 4:125567/140‑1 (MQ=255)
gctgcCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGCCa < 4:714146/140‑1 (MQ=255)
gctgcCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGCCa < 8:555974/140‑1 (MQ=255)
gctgcCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTGGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGc < 5:47387/138‑1 (MQ=255)
gcCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGCCaa < 6:204786/138‑1 (MQ=255)
gcCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGCCAACa < 3:679393/140‑1 (MQ=255)
gcCAGGCGCTGATGTGTCCGGCGTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCGCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGATCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGCCaa < 6:385475/138‑1 (MQ=255)
ccAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGGTGCCCTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCGAGACGGCGGCGGCAGGTAAGGCAGTTAAAACAACAGCGTACAATGCCGGGCAAcca > 4:292852/1‑138 (MQ=255)
cTGATGTGTCCGGCTTCTGAGCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGCCAACATCCaga < 5:109286/138‑1 (MQ=255)
cTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTGCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGCCAACATCCaga < 5:134263/138‑1 (MQ=255)
gtgtCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGCCAACATCCAGAGGCACtt < 4:604827/140‑1 (MQ=255)
tCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCACAAAGCGTACCCTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCACCGGCTGCGGCAGTTCAGGCACTTCCAAAAACAGCTTAACATTCGGGCCCACAACCAACGGCCCATCAc > 8:283471/1‑140 (MQ=255)
tCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGGT‑TGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTGCGTCGCTCTCCGGCGGCGGCAGTTGAGGCAGTTGAATAAACAGCATAACATTCGGGCCAACCTACAGAGGCAcataac > 2:516896/1‑135 (MQ=255)
ccATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGTCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGCCAACATCCAGAGGCACTTCACCGCTTGCCAGCg < 1:516896/140‑1 (MQ=255)
cGGTCGCGTT‑TGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGCCAACATCCAGAGGCACTTCACCGCTTGCCAGCGGCt < 6:721265/138‑1 (MQ=255)
cGGTCGCGTT‑TGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGCCAACATCCAGAGGCACTTCACCGCTTGCCAGCGGCTTg < 1:573855/140‑1 (MQ=255)
gcgcgGT‑TGGGTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCATGCAGTTCAATCACCTGCTTACCTTGCGGGCCAACATCCAGAGGCCCTTCACCGCTTGCCAGCGGCTTGCCa < 2:536567/139‑1 (MQ=255)
gcgTT‑TGGTAGCACTACGCGGACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGGTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGCCAACCTCCAGAGGCACTTCACCGCTTGCCAGCGGCTTGCCATc < 7:654655/140‑1 (MQ=255)
tt‑tGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGCCAACATCCAGAGGCACTTCACCGCTTGCCAGCGGCTTGCCATcc < 6:563067/138‑1 (MQ=255)
tt‑tGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGCCAACATCCAGAGGCACTTCACCGCTTGCCAGCGGCTTGCCATCCAg < 3:985943/140‑1 (MQ=255)
tt‑tGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGCCAACATCCAGAGGCACTTCACCGCTTGCCAGCGGCTTGCCATCCAg < 2:230212/140‑1 (MQ=255)
tt‑tGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTCACCTTGCGGGCCAACATCCAGAGGCACTTCACCGCTTGCCAGCGGCTTGCCATCCAg < 1:668277/140‑1 (MQ=255)
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CTCGATGCAAAAATCCGTTCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTT‑TGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGCCAACATCCAGAGGCACTTCACCGCTTGCCAGCGGCTTGCCATCCAG > NZ_CP022686/3935185‑3935463
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
