Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F2 I0 R1
|
252 |
7301.5 |
9636800 |
98.5% |
9492248 |
135.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP022686 |
3,935,324 |
T→G |
14.6% |
N705T (AAC→ACC) |
lacZ ← |
beta‑galactosidase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP022686 | 3,935,324 | 0 | T | G | 14.6%
| 324.7
/ 17.2
| 186 | N705T (AAC→ACC) | lacZ | beta‑galactosidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (26/128); new base G (29/2); total (55/131) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.86e-16 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 205 total aligned reads displayed.
CTCGATGCAAAAATCCGTTCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGCCAACATCCAGAGGCACTTCACCGCTTGCCAGCGGCTTGCCATCCAG > NZ_CP022686/3935185‑3935463
|
cGATGCAAAAATCCGTTCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGACAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGt > 1:483069/1‑138 (MQ=255)
aTGCAAAAATCCGTTCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGttt < 1:649760/138‑1 (MQ=255)
aTGCAAAAATCCGTTCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGGGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTgg < 4:1131901/140‑1 (MQ=255)
aTGCAAAAATCCGTTCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGGGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTgg < 4:1004864/140‑1 (MQ=255)
aTGCAAAAATCCGTTCCGCTGGGGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTgg < 5:418989/140‑1 (MQ=255)
aTGCAAAAATCCGGTCCGCTGGGGCTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGGTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGttt < 1:1030861/138‑1 (MQ=255)
tGCAAAAATCCGTTCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGCCGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGTTCGCGGTTGGt > 3:232202/1‑140 (MQ=255)
tGCAAAAATCCGTTCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGt < 3:1027728/140‑1 (MQ=255)
tGCAAAAATCCGTTCCGCTGGTGGTCAGATGAGGGATGGCTGGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGGTTCGt > 6:728751/1‑140 (MQ=255)
cAAAAATCCGTTCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGGTTGGt > 1:1079412/1‑138 (MQ=255)
cAAAAATCCGTTCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGCGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGtgttgg > 1:1014735/1‑133 (MQ=255)
aaaaaTCCGTTCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGTAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGc < 7:366253/140‑1 (MQ=255)
aaaaTCCGTTCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGGCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATTCGGTCGCGTTTGGTTGCa < 3:969821/140‑1 (MQ=255)
aaaaTCCGTTCCGCTGGTGGGCAGGTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGCa < 6:15737/140‑1 (MQ=255)
atctCCGTTCCGCTGGTGGTCAGTTTATTTATGTAGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGCGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCGTGCGGTCGCGGTGGGTTGcgc > 8:119277/4‑138 (MQ=255)
aaaTCCGTTCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGCAc < 6:849910/140‑1 (MQ=255)
aaaTCCGTTCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGCAc < 4:642523/140‑1 (MQ=255)
aaaTCCGTTCCGCTGGTGGTCAGTGGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGGTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGCAc < 8:576858/140‑1 (MQ=255)
aaaTCCGTTCCGCTGGTGGGCCGTGGAGGGATGGCGGGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGc < 2:1116070/138‑1 (MQ=255)
aaTCCGTTCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGCa < 2:605096/138‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGCACTAcgcg < 7:638182/140‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGACAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGCACTAcgcg < 3:384592/140‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGAGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGCACTAcgcg < 6:116496/140‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGGTGGGCAGTTGTGGGATGGCGTGGGCCGCGGAGGGGAGAGGCACGCGGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCAGCCAGGCGCGGATGTGGCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGCACTAcgcg < 5:597703/140‑1 (MQ=255)
gTTCCGCGGGTGGGCAGTTGAGGGAGGGCGGGGGCCGCGGAGGGGAGTGTCCCGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGCACTAcgcg < 8:487799/140‑1 (MQ=255)
gCTGGTGGTCTGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGGTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGCACTACGCGTAc < 1:394974/138‑1 (MQ=255)
gCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGCACTACGCGTAc < 1:365749/138‑1 (MQ=255)
gCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGCACTACGCGTACCg < 5:155713/140‑1 (MQ=255)
gCTGGTGGGCAGTGGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGGTTGGTTGCACTACGCGTACCg < 6:564329/140‑1 (MQ=255)
gCTGGGGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGATGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGCACTACGCGTACCg < 8:239517/140‑1 (MQ=255)
ccggttgggCAGGTGAGGGATGGCGGGGGACGCGGCGGGGAGTGTCACGCTGAGGTGTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGCACTACGCGTACCg < 8:834161/135‑1 (MQ=255)
tgggCAGGTGAGTTATGTCTTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGATGAGGTTTTCCTCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCTTGCGGTCGAGTGTGGTTGAACTACGCGTACCGTTAga < 4:851018/140‑2 (MQ=255)
gtCAGGTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTTTCACGATGAGGTTTTCCTCCAGACGCCATTGCTGCAAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGGTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCa < 6:348341/140‑1 (MQ=255)
gATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCgg < 6:459816/140‑1 (MQ=255)
tGGCGTGGGACGCGGAGGGGATTGTCACGCTGAGGTTTGCCGCCAGACGCCTTTGCTGCGAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGgcg < 3:1134487/140‑1 (MQ=255)
tGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGgcg < 6:1053773/140‑1 (MQ=255)
ggCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGgcgc < 8:18319/140‑1 (MQ=255)
gCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGGTTGGTTGCCCAAAGCGTACCGTTAGCCAGAGGTGTGCgggggg > 5:495096/1‑136 (MQ=255)
gCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGAGGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTGTGGGTGAACTACGCGGACCGGTTGCCCGCGGTGGGCGgcgcg > 4:1218819/1‑139 (MQ=255)
gTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTTCACTACGCGTACCGGTTGCCAGAGTTGTGCGgcgcg > 2:164722/1‑137 (MQ=255)
gTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGctct < 5:458581/140‑1 (MQ=255)
gTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGGTTGGGTGCACTACGCGTACCGGTAGCCAGAGGTGTCCGgcgcg > 2:822393/1‑137 (MQ=255)
gggACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGGTTGGTTTCACTACCCGTTCCCTTAGCCACCGTTTTGCGgcgcacacc > 6:1144307/1‑135 (MQ=255)
ggACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGCACTACGCGTACCCTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCtctc > 2:883622/1‑138 (MQ=255)
gACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGGACGACGCGTACCGGTAGCCAGAGTTGTACGgcgcgcgcccg > 5:925693/1‑133 (MQ=255)
ggAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCg < 4:1098739/140‑1 (MQ=255)
ggAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCg < 4:56485/140‑1 (MQ=255)
ggAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGGTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCCGAGTTTTCCGGCGCGCGCCCgcggcg > 8:1015399/1‑140 (MQ=255)
ggAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGGTTGGTTGCACTACGCGTAACGGTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCGCTCCGgcggcg > 3:472123/1‑140 (MQ=255)
gAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTg > 2:1040814/1‑137 (MQ=255)
gAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGGTTGGTTGCCCTACGCGGACCGGTATCCAGCGGTGTCCGGGGCGCGCCGGCTGc > 1:105211/1‑138 (MQ=255)
ggAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCggcagt < 3:745585/140‑1 (MQ=255)
ggAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCggcagt < 7:121845/140‑1 (MQ=255)
gtCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTTGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCggcagttcagg < 6:928146/140‑1 (MQ=255)
gtCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCggcagttcagg < 7:794556/140‑1 (MQ=255)
gtCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCggcagttcagg < 6:1104780/140‑1 (MQ=255)
gtCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGGTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCggcagttcagg < 3:1122426/140‑1 (MQ=255)
gtCACGCTGAGGGTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCggcagttcagg < 7:233022/140‑1 (MQ=255)
cACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCggcagttcaggca < 5:1000525/140‑1 (MQ=255)
cGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGCCCTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTTTACGGCGCGCTACGGCGGCggcagttaacgcagt > 4:188183/1‑140 (MQ=255)
cGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGGTTTGTTGCACGACGCGTACCGTTTGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCGGCggcaggtcaggcagt > 8:640197/1‑140 (MQ=255)
cGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGGTTGGTTGCACTACCCCTACCCTTAGCCAGCGTTGTCCCGGCCTCTACGGCGGGggcagttgaggcact > 4:1149159/1‑138 (MQ=255)
gCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCggcagttcaggcagtt < 3:1107331/140‑1 (MQ=255)
gCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCggcagttcaggcag < 1:241066/138‑1 (MQ=255)
tGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCggcagttcaggcagtt < 1:496932/138‑1 (MQ=255)
aGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTtcaat < 3:611980/140‑1 (MQ=255)
gggtttCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTtcaatc < 6:644924/137‑1 (MQ=255)
ggTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTtcaatc < 5:336368/140‑1 (MQ=255)
ggTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTtcaatc < 6:261151/140‑1 (MQ=255)
gTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGGACTACGCGTACCGTTATCCAGAGTTGTACGGCGCGCTCCCGCTGCgggagttgaggcaggtaaaa > 1:454936/1‑132 (MQ=255)
tCCGCCAGACGCAATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGGTTGGTTGCACTTCGCGTAACGTTAGACAGCGTTGTCCGGCGCTCGCCGGCTTCGGCAGTTCTGGCAGGTCAATAAAcag > 8:764538/1‑138 (MQ=255)
cGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCt < 3:1187793/140‑1 (MQ=255)
cGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGGCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTg < 8:216334/140‑1 (MQ=255)
ccATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCg < 7:552294/140‑1 (MQ=255)
tgctgcCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGCACTACGAGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGcc < 5:10872/140‑1 (MQ=255)
gctgcCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCCTGCGGTCGCGTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGc < 2:983845/138‑1 (MQ=255)
gctgcCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGc < 1:730347/138‑1 (MQ=255)
gctgcCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGCCa < 6:601307/140‑1 (MQ=255)
gctgcCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGCCa < 4:789249/140‑1 (MQ=255)
gctgcCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGCCa < 4:774038/140‑1 (MQ=255)
gcggcCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTGCTCACCATGCGGTCGCGAGTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGc < 2:369533/135‑1 (MQ=255)
gcCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGCCaa < 2:394835/138‑1 (MQ=255)
aGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTg > 2:591803/1‑46 (MQ=255)
aGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTg < 1:591803/46‑1 (MQ=255)
aGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGCACAACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTACGGCGCTCTCCGGCAGCGGCAGTTCAGGCAGTTGAATAAACTGGTTACCTTTGGGGCCAACaaac > 4:519037/1‑137 (MQ=255)
gcgcTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGCCAACATCCag < 5:245365/140‑1 (MQ=255)
gcTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGCCAACATCCagag < 8:254421/140‑1 (MQ=255)
cTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGCCAACATCCAGAgg < 5:74973/140‑1 (MQ=255)
cTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCGCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTAACTTGCGGGCCCACAACCAGAGGCCCTTAACCGc > 2:734635/1‑138 (MQ=255)
gACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGCCAACATCCAGAGGCACTTCACCGCTTGCCAg < 3:336672/140‑1 (MQ=255)
gACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGCCAACATCCAGAGGCACTTCACCGCTTGCCAg < 7:857678/140‑1 (MQ=255)
aTGCGGTCGCGTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGCCAACATCCAGAGGCACTTCACCGCTTGCCAGCg < 2:488627/138‑1 (MQ=255)
cGGTCGCGTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGCCAACATCCAGAGGCACTTCACCGCTTGCCAGCGGCTTg < 8:415887/140‑1 (MQ=255)
ggTCGCGTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGCCAACATCCAGAGGCACTTCACCGCTTGCCAGCGGCTTGc < 7:871798/140‑1 (MQ=255)
tCGCGTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGCCAACATCCAGAGGCACTTCACCGCTTGCCAGCGGCTTGCCa < 3:827257/140‑1 (MQ=255)
gcgcgTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGGTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGTCCAACATCCAGAGGCACTTCACCGCTTGCCAGCGGCTTGCCa < 4:41330/139‑1 (MQ=255)
tttGGTTGCACTACTCGTACCGTTTGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGCCAACATCCAGAGGCACTTCACCGCTTGCCAGCGGCTTGCCATCCAg < 4:30526/140‑1 (MQ=255)
tttGGTTGCACTACGCGTTCCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCGCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGACAACATCCAGAGGCACTTCACCGCTTGCCAGCGGCTTGCCATCCAg < 8:164844/140‑1 (MQ=255)
tttGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGGTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGCCAACATCCAGAGGCACTTCACCGCTTGCCAGCGGCTTGCCATCCAg < 7:457660/140‑1 (MQ=255)
tttGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGGTGGCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGCCAACATCCAGAGGCACTTCACCGCTTGCCAGCGGCTTGCCATCCAg < 7:906971/140‑1 (MQ=255)
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CTCGATGCAAAAATCCGTTCCGCTGGTGGTCAGTTGAGGGATGGCGTGGGACGCGGAGGGGAGTGTCACGCTGAGGTTTTCCGCCAGACGCCATTGCTGCCAGGCGCTGATGTGTCCGGCTTCTGACCATGCGGTCGCGTTTGGTTGCACTACGCGTACCGTTAGCCAGAGTTGTCCGGCGCTCTCCGGCTGCGGCAGTTCAGGCAGTTCAATCAACTGCTTACCTTGCGGGCCAACATCCAGAGGCACTTCACCGCTTGCCAGCGGCTTGCCATCCAG > NZ_CP022686/3935185‑3935463
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
