Notes

Publication:

10.1126/science.1212986

ALE, flask, and isolate counts

ALE replicate Flask count Isolate count
0 1 1
1 1 1
2 1 1
3 1 1
4 1 1
5 1 1
6 1 1
7 1 1
8 1 1
9 1 1
10 1 1
11 1 1
12 1 1
13 1 1
14 1 1
15 1 1
16 1 1
17 1 1
18 1 1
20 1 1
21 1 1
22 1 1
23 1 1
24 1 1
25 1 1
26 1 1
27 1 1
28 1 1
31 1 1
32 1 1
33 1 1
34 1 1
35 1 1
38 1 1
39 1 1
40 1 1
41 1 1
42 1 1
43 1 1
44 1 1
45 1 1
46 1 1
47 1 1
48 1 1
51 1 1
52 1 1
53 1 1
54 1 1
55 1 1
56 1 1
57 1 1
58 1 1
59 1 1
60 1 1
61 1 1
64 1 1
65 1 1
66 1 1
67 1 1
68 1 1
69 1 1
70 1 1
71 1 1
72 1 1
73 1 1
74 1 1
75 1 1
76 1 1
77 1 1
78 1 1
79 1 1
80 1 1
81 1 1
82 1 1
83 1 1
84 1 1
85 1 1
86 1 1
87 1 1
89 1 1
91 1 1
92 1 1
93 1 1
94 1 1
95 1 1
97 1 1
101 1 1
105 1 1
106 1 1
107 1 1
108 1 1
110 1 1
112 1 1
114 1 1
118 1 1
119 1 1
120 1 1
122 1 1
124 1 1
126 1 1
127 1 1
130 1 1
131 1 1
132 1 1
133 1 1
134 1 1
135 1 1
136 1 1
137 1 1
138 1 1
139 1 1
142 1 1
143 1 1
113 113 113

ALE experiment mutation counts

Mutation Type Unique Observed
Single Base Substitutions 690 1153
Multiple Base Substitutions 4 4
Deletions 172 343
Insertions 70 313
Mobile Element Insertions 46 172
Amplifications 0 0
Gene Conversions 0 0
Inversions 0 0
Total 982 1985

Sample Resequencing Stats

Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate Predicted Mutations Unassigned Missing Coverage Evidence Mean Coverage Total Reads Percent Mapped Mapped Reads Average Read Length
A0 F1 I1 R1 7 0 175.1 22577466 95.2% 21493747 37.0
A1 F1 I1 R1 17 0 37.0 2377229 96.2% 2286894 75.9
A2 F1 I1 R1 14 0 24.7 1576304 96.5% 1521133 75.8
A3 F1 I1 R1 18 0 29.2 1933165 95.1% 1838439 75.7
A4 F1 I1 R1 15 0 35.6 2322208 94.1% 2185197 75.8
A5 F1 I1 R1 19 0 34.1 2156969 96.4% 2079318 75.9
A6 F1 I1 R1 20 0 51.0 3438118 91.8% 3156192 75.9
A7 F1 I1 R1 20 0 54.5 3547384 95.1% 3373562 76.0
A8 F1 I1 R1 15 0 61.9 4096487 94.5% 3871180 75.9
A9 F1 I1 R1 16 0 55.7 3673927 94.4% 3468187 75.9
A10 F1 I1 R1 14 0 23.9 1506608 98.1% 1477982 76.0
A11 F1 I1 R1 21 0 62.2 4089897 94.3% 3856772 75.9
A12 F1 I1 R1 18 0 38.4 2430560 95.7% 2326045 75.9
A13 F1 I1 R1 17 0 44.3 2973330 95.1% 2827636 75.9
A14 F1 I1 R1 17 0 21.6 1356596 98.4% 1334890 76.0
A15 F1 I1 R1 14 0 43.4 2705329 98.7% 2670159 76.0
A16 F1 I1 R1 16 0 38.1 2332770 98.7% 2302443 76.0
A17 F1 I1 R1 15 0 26.4 1686296 95.9% 1617157 76.0
A18 F1 I1 R1 18 0 50.6 3235256 96.4% 3118786 76.0
A20 F1 I1 R1 17 0 44.7 2849266 96.8% 2758089 76.0
A21 F1 I1 R1 16 0 43.9 3070277 96.2% 2953606 75.9
A22 F1 I1 R1 17 0 44.7 2806446 96.5% 2708220 76.0
A23 F1 I1 R1 14 0 40.5 2605368 96.4% 2511574 75.9
A24 F1 I1 R1 18 0 37.8 2419812 96.5% 2335118 76.0
A25 F1 I1 R1 14 0 46.3 3075166 96.7% 2973685 76.0
A26 F1 I1 R1 14 0 45.0 2861610 96.8% 2770038 76.0
A27 F1 I1 R1 17 0 37.2 2333115 96.5% 2251455 75.9
A28 F1 I1 R1 15 0 45.6 2893554 96.7% 2798066 76.0
A31 F1 I1 R1 21 0 37.9 2424921 96.5% 2340048 76.0
A32 F1 I1 R1 13 0 41.3 2638873 95.5% 2520123 75.9
A33 F1 I1 R1 22 0 54.4 3455062 95.8% 3309949 75.9
A34 F1 I1 R1 18 0 56.1 3547650 96.9% 3437672 76.0
A35 F1 I1 R1 21 0 46.3 3071142 93.0% 2856162 75.9
A38 F1 I1 R1 17 0 54.1 3391312 97.1% 3292963 75.9
A39 F1 I1 R1 15 0 59.3 3695894 97.1% 3588713 75.9
A40 F1 I1 R1 16 0 59.7 3732628 97.2% 3628114 76.0
A41 F1 I1 R1 21 0 57.1 3643130 97.0% 3533836 75.9
A42 F1 I1 R1 17 0 53.4 3386926 97.4% 3298865 76.0
A43 F1 I1 R1 17 0 61.8 3886062 97.4% 3785024 76.0
A44 F1 I1 R1 19 0 54.5 3474856 97.7% 3394934 76.0
A45 F1 I1 R1 14 0 53.1 3307936 97.7% 3231853 76.0
A46 F1 I1 R1 17 0 71.0 4433184 98.0% 4344520 76.0
A47 F1 I1 R1 17 0 69.1 4502028 96.3% 4335452 75.9
A48 F1 I1 R1 19 0 65.6 4133022 97.0% 4009031 76.0
A51 F1 I1 R1 20 0 58.0 3778966 96.2% 3635365 75.9
A52 F1 I1 R1 19 0 66.0 4263516 97.2% 4144137 76.0
A53 F1 I1 R1 17 0 63.8 4051746 97.3% 3942348 76.0
A54 F1 I1 R1 16 0 53.7 3449390 96.4% 3325211 75.9
A55 F1 I1 R1 18 0 62.6 3986840 96.5% 3847300 75.9
A56 F1 I1 R1 16 0 62.6 4005459 97.2% 3893306 75.9
A57 F1 I1 R1 16 0 65.9 4148770 97.1% 4028455 75.9
A58 F1 I1 R1 18 0 55.3 3756050 96.8% 3635856 75.9
A59 F1 I1 R1 21 0 55.8 3542164 96.7% 3425272 76.0
A60 F1 I1 R1 14 0 61.1 3976207 96.5% 3837039 76.0
A61 F1 I1 R1 19 0 50.7 3232285 96.8% 3128851 74.9
A64 F1 I1 R1 17 0 58.5 3743480 96.8% 3623688 76.0
A65 F1 I1 R1 19 0 67.5 4307580 97.2% 4186967 74.9
A66 F1 I1 R1 19 0 57.4 3651244 97.1% 3545357 76.0
A67 F1 I1 R1 17 0 65.0 4212288 95.3% 4014310 75.9
A68 F1 I1 R1 17 0 56.4 3914180 96.2% 3765441 75.9
A69 F1 I1 R1 20 0 59.3 3764421 95.9% 3610079 75.9
A70 F1 I1 R1 18 0 48.6 3152226 95.8% 3019832 76.0
A71 F1 I1 R1 18 0 59.4 3821164 95.9% 3664496 75.9
A72 F1 I1 R1 16 0 60.6 3810144 97.0% 3695839 75.8
A73 F1 I1 R1 21 0 62.0 3993596 96.1% 3837845 76.0
A74 F1 I1 R1 16 0 49.9 3507628 96.2% 3374338 75.9
A75 F1 I1 R1 16 0 50.8 3316832 95.7% 3174208 75.9
A76 F1 I1 R1 13 0 52.2 3332858 96.5% 3216207 76.0
A77 F1 I1 R1 21 0 53.0 3608474 95.6% 3449701 76.0
A78 F1 I1 R1 16 0 49.7 3184232 95.8% 3050494 76.0
A79 F1 I1 R1 19 0 52.0 3333102 95.7% 3189778 75.9
A80 F1 I1 R1 17 0 48.4 3161007 95.9% 3031405 76.0
A81 F1 I1 R1 13 0 64.8 4113440 96.3% 3961242 75.9
A82 F1 I1 R1 16 0 52.8 3323890 97.1% 3227497 76.0
A83 F1 I1 R1 17 0 39.7 2446701 98.6% 2412447 76.0
A84 F1 I1 R1 17 0 47.9 3074446 96.0% 2951468 76.0
A85 F1 I1 R1 15 0 51.9 3515760 95.5% 3357550 75.9
A86 F1 I1 R1 15 0 50.6 3276358 95.9% 3142027 75.9
A87 F1 I1 R1 13 0 46.2 2986023 95.8% 2860610 75.9
A89 F1 I1 R1 15 0 55.0 3646496 95.5% 3482403 75.9
A91 F1 I1 R1 18 0 55.4 3661525 95.1% 3482110 76.0
A92 F1 I1 R1 15 0 58.2 3997918 96.1% 3841999 76.0
A93 F1 I1 R1 15 0 55.4 3682408 94.4% 3476193 75.9
A94 F1 I1 R1 15 0 48.6 3202402 95.4% 3055091 75.9
A95 F1 I1 R1 16 0 38.4 2546724 96.0% 2444855 75.9
A97 F1 I1 R1 18 0 21.9 1431356 95.6% 1368376 76.0
A101 F1 I1 R1 20 0 160.9 10398134 92.8% 9649468 75.9
A105 F1 I1 R1 16 0 277.3 18051348 92.9% 16769702 75.9
A106 F1 I1 R1 16 0 286.4 19211214 90.7% 17424571 75.8
A107 F1 I1 R1 19 0 326.9 20855348 93.1% 19416328 75.9
A108 F1 I1 R1 80 0 195.1 12639756 93.3% 11792892 75.9
A110 F1 I1 R1 14 0 278.2 17968888 92.5% 16621221 75.9
A112 F1 I1 R1 17 0 249.1 16570612 93.0% 15410669 76.0
A114 F1 I1 R1 20 0 239.5 15463816 93.1% 14396812 76.0
A118 F1 I1 R1 15 0 203.6 13305188 92.8% 12347214 75.9
A119 F1 I1 R1 20 0 247.5 15984500 92.7% 14817631 75.9
A120 F1 I1 R1 20 0 248.8 16334864 93.0% 15191423 76.0
A122 F1 I1 R1 27 0 151.2 10056804 92.4% 9292486 76.0
A124 F1 I1 R1 18 0 228.8 14151462 95.4% 13500494 76.0
A126 F1 I1 R1 14 0 223.8 14402144 95.1% 13696438 76.0
A127 F1 I1 R1 15 0 330.5 20417406 95.5% 19498622 76.0
A130 F1 I1 R1 13 0 250.2 15681636 95.5% 14975962 76.0
A131 F1 I1 R1 13 0 244.3 15300636 95.6% 14627408 76.0
A132 F1 I1 R1 21 0 265.3 16744490 95.4% 15974243 76.0
A133 F1 I1 R1 21 0 238.6 15028552 95.5% 14352267 76.0
A134 F1 I1 R1 15 0 220.5 13917488 95.6% 13305118 76.0
A135 F1 I1 R1 14 0 200.0 12709596 94.6% 12023277 76.0
A136 F1 I1 R1 21 0 250.8 15742942 95.7% 15065995 76.0
A137 F1 I1 R1 18 0 221.5 13936938 95.6% 13323712 76.0
A138 F1 I1 R1 17 0 163.5 10262604 95.7% 9821312 76.0
A139 F1 I1 R1 15 0 48.9 3081653 97.3% 2998448 76.0
A142 F1 I1 R1 21 0 42.6 2691336 96.3% 2591756 76.0
A143 F1 I1 R1 16 0 39.8 2536279 96.2% 2439900 76.0

Mutation Needle Plot

Mutation Targets

Entries to show